Mir-430-P5

MirGeneDB ID

Eca-Mir-430-P5

Family name

MIR-430 (all species)

Seed

CUCAAAC

Species

Horse (Equus caballus)

MiRBase ID

eca-mir-371

Paralogues

Eca-Mir-430-P1 Eca-Mir-430-P2 Eca-Mir-430-P3 Eca-Mir-430-P4 Eca-Mir-430-P6 Eca-Mir-430-P7

Orthologues

Bta-Mir-430-P5 Cfa-Mir-430-P5d1 Cfa-Mir-430-P5d2 Cja-Mir-430-P5 Cpo-Mir-430-P5 Dno-Mir-430-P5 Ete-Mir-430-P5 Hsa-Mir-430-P5 Laf-Mir-430-P5 Mml-Mir-430-P5 Mmr-Mir-430-P5e Mmr-Mir-430-P5f Mmu-Mir-430-P5a Mmu-Mir-430-P5b Mmu-Mir-430-P5c Ocu-Mir-430-P5 Pab-Mir-430-P5 Rno-Mir-430-P5a Rno-Mir-430-P5b Rno-Mir-430-P5c Xla-Mir-430-o5o1 Xla-Mir-430-o5o2 Xla-Mir-430-o5p1 Xla-Mir-430-o5p2 Xla-Mir-430-o5q1 Xla-Mir-430-o5q2 Xla-Mir-430-o5r Xla-Mir-430-o5s Xtr-Mir-430-o5a1 Xtr-Mir-430-o5a2 Xtr-Mir-430-o5a3 Xtr-Mir-430-o5a4 Xtr-Mir-430-o5a5 Xtr-Mir-430-o5a6 Xtr-Mir-430-o5a7 Xtr-Mir-430-o5a8 Xtr-Mir-430-o5a9 Xtr-Mir-430-o5a10 Xtr-Mir-430-o5a11 Xtr-Mir-430-o5a12 Xtr-Mir-430-o5a13 Xtr-Mir-430-o5a14 Xtr-Mir-430-o5a15 Xtr-Mir-430-o5a16 Xtr-Mir-430-o5a17 Xtr-Mir-430-o5a18 Xtr-Mir-430-o5a19 Xtr-Mir-430-o5a20 Xtr-Mir-430-o5a21 Xtr-Mir-430-o5a22 Xtr-Mir-430-o5a23 Xtr-Mir-430-o5b Xtr-Mir-430-o5c1 Xtr-Mir-430-o5c2 Xtr-Mir-430-o5c3 Xtr-Mir-430-o5c4 Xtr-Mir-430-o5c5 Xtr-Mir-430-o5c6 Xtr-Mir-430-o5c7 Xtr-Mir-430-o5c8 Xtr-Mir-430-o5c9 Xtr-Mir-430-o5c10 Xtr-Mir-430-o5c11 Xtr-Mir-430-o5c12 Xtr-Mir-430-o5c13 Xtr-Mir-430-o5c14 Xtr-Mir-430-o5c15 Xtr-Mir-430-o5c16 Xtr-Mir-430-o5c17 Xtr-Mir-430-o5c18 Xtr-Mir-430-o5c19 Xtr-Mir-430-o5c20 Xtr-Mir-430-o5c21 Xtr-Mir-430-o5c22 Xtr-Mir-430-o5c23 Xtr-Mir-430-o5c24 Xtr-Mir-430-o5c25 Xtr-Mir-430-o5d1 Xtr-Mir-430-o5d2 Xtr-Mir-430-o5e Xtr-Mir-430-o5f1 Xtr-Mir-430-o5f2 Xtr-Mir-430-o5g Xtr-Mir-430-o5h Xtr-Mir-430-o5j Xtr-Mir-430-o5k1 Xtr-Mir-430-o5k2 Xtr-Mir-430-o5k3 Xtr-Mir-430-o5k4 Xtr-Mir-430-o5k5 Xtr-Mir-430-o5k6 Xtr-Mir-430-o5k7 Xtr-Mir-430-o5k8 Xtr-Mir-430-o5k9 Xtr-Mir-430-o5k10 Xtr-Mir-430-o5k11 Xtr-Mir-430-o5k12 Xtr-Mir-430-o5k13 Xtr-Mir-430-o5k14 Xtr-Mir-430-o5k15 Xtr-Mir-430-o5k16 Xtr-Mir-430-o5k17 Xtr-Mir-430-o5k18 Xtr-Mir-430-o5k19 Xtr-Mir-430-o5k20 Xtr-Mir-430-o5k21 Xtr-Mir-430-o5k22 Xtr-Mir-430-o5k23 Xtr-Mir-430-o5k24 Xtr-Mir-430-o5k25 Xtr-Mir-430-o5k26 Xtr-Mir-430-o5k27 Xtr-Mir-430-o5l1 Xtr-Mir-430-o5l2 Xtr-Mir-430-o5l3 Xtr-Mir-430-o5l4 Xtr-Mir-430-o5l5 Xtr-Mir-430-o5l6 Xtr-Mir-430-o5l7 Xtr-Mir-430-o5l8 Xtr-Mir-430-o5l9 Xtr-Mir-430-o5l10 Xtr-Mir-430-o5l11 Xtr-Mir-430-o5l12 Xtr-Mir-430-o5l13 Xtr-Mir-430-o5l14 Xtr-Mir-430-o5l15 Xtr-Mir-430-o5l16 Xtr-Mir-430-o5l17 Xtr-Mir-430-o5l18 Xtr-Mir-430-o5l19 Xtr-Mir-430-o5m Xtr-Mir-430-o5n1 Xtr-Mir-430-o5n2

Node of Origin (locus)

Eutheria

Node of Origin (family)

Vertebrata

Genome context
(GCA_002863925.1_EquCab3.0)

CM009157.1: 23262827-23262886 [+] UCSC Ensembl

Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-430-P5)

Mir-430-P5 CM009157.1: 23262827-23262886 [+] UCSC Ensembl
Mir-430-P6 CM009157.1: 23263034-23263093 [+] UCSC Ensembl

Precursor
(pre-Mir +30nt flank)

UCUCUUGUGUGGAAUUACUCAACUUGUGCUACUCAAACUGUGGGGGCACUUUCUGUGCUACGUAGGGAAGUGCCGCCAUUUUUUGAGUGUUACCGGUUGAGAAAGUACCUUCUAGUUGGC

Get precursor sequence

Structure

        10          20        30        40        50         
UCUCUUGUGUGGAAUUA--|      U   C        CU    G        CUGUGC 
                   CUCAACU GUG UACUCAAA  GUGG GGCACUUU      U
                   GAGUUGG CAU GUGAGUUU  UACC CCGUGAAG      A
CGGUUGAUCUUCCAUGAAA^      C   U        UU    G        GGAUGC 
.       110       100        90        80        70        60