| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-26-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-26 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-26b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mmu-Mir-26-P1 Mmu-Mir-26-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-26-P2 Bta-Mir-26-P2 Cfa-Mir-26-P2 Cja-Mir-26-P2 Cli-Mir-26-P2 Cpi-Mir-26-P2 Cpo-Mir-26-P2 Dno-Mir-26-P2 Dre-Mir-26-P2a Eca-Mir-26-P2 Ete-Mir-26-P2 Gga-Mir-26-P2 Gja-Mir-26-P2 Gmo-Mir-26-P2a Gmo-Mir-26-P2b Hsa-Mir-26-P2 Laf-Mir-26-P2 Lch-Mir-26-P2 Loc-Mir-26-P2 Mal-Mir-26-P2a Mal-Mir-26-P2b Mdo-Mir-26-P2 Mml-Mir-26-P2 Mmr-Mir-26-P2 Mun-Mir-26-P2 Neu-Mir-26-P2 Oan-Mir-26-P2 Ocu-Mir-26-P2 Pab-Mir-26-P2 Pbv-Mir-26-P2 Pma-Mir-26-o2 Rno-Mir-26-P2 Sha-Mir-26-P2 Spt-Mir-26-P2 Sto-Mir-26-P2 Tgu-Mir-26-P2 Tni-Mir-26-P2b Xla-Mir-26-P2e Xla-Mir-26-P2f Xtr-Mir-26-P2c Xtr-Mir-26-P2d | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr1: 74394324-74394381 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCCCUCUUACCCCUACUGCCCGGGACCCAGUUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUUGUGGUGCUGACCAGCCUGUUCUCCAUUACUUGGCUCGGGGGCCGGUGCCCUGCAGCCUUGGGGUGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCCCUCUUACCCCUACU- - GA -| U UC GUGGU GC CCGG CCC AGU CAAGUAAU AGGAUAGGUU G CG GGCC GGG UCG GUUCAUUA UCUUGUCCGA C AGUGGGGUUCCGACGUCC U GG C^ - CC CCAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Mmu-Mir-26-P2_5p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0000534 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000534 TargetScanVert: mmu-miR-26b-5p miRDB: MIMAT0000534 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Mmu-Mir-26-P2_3p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0004630 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCUGUUCUCCAUUACUUGGCUC -58
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004630 TargetScanVert: mmu-miR-26b-3p miRDB: MIMAT0004630 |
