MirGeneDB ID | Agr-Mir-2-P12b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | West Indian fuzzy chiton (Acanthopleura granulata ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Agr-Mir-2-P12a Agr-Mir-2-P12c Agr-Mir-2-P12d Agr-Mir-2-P12e Agr-Mir-2-P12f1 Agr-Mir-2-P12f2 Agr-Mir-2-o85 Agr-Mir-2-o86a-v1 Agr-Mir-2-o86a-v2 Agr-Mir-2-o86b Agr-Mir-2-o87-v1 Agr-Mir-2-o87-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cte-Mir-2-P12 Dgr-Mir-2-P12 Esc-Mir-2-P12 Gsp-Mir-2 Hru-Mir-2-P12 Lgi-Mir-2-P12b Lhy-Mir-2-P12 Llo-Mir-2-P12 Mgi-Mir-2-P12 Npo-Mir-2-P12 Obi-Mir-2-P12 Ofu-Mir-2-P12 Ovu-Mir-2-P12 Pau-Mir-2-P12 Pdu-Mir-2-P12 Ple-Mir-2 Pve-Mir-2-P12 Rph-Mir-2-P12 War-Mir-2-P12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | A. granulata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_016165875.1_ASM1616587v1_Acanthopleura_granula) |
JABBOT010000002.1: 46260136-46260192 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AACAAAUGAGCAGUGCCUGGUUAGUGGCUCUGACCAAGUGGUUGUGGUCUGUAGUAAGUCGUCAUAUCACAGCCUGCUUGGAUCAGAAUCACUGGACCACUGGACACCACGCUACUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 AACAAAUGAGCAGUGCC- - GC - -| C UAGUA UGGU UAGUG UCUGA CCAAGU GGUUGUGGU UG \ ACCA GUCAC AGACU GGUUCG CCGACACUA AC A GUCAUCGCACCACAGGUC G UA A U^ U UGCUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Agr-Mir-2-P12b_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGACCAAGUGGUUGUGGUCUG -21
Get sequence
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Mature sequence | Agr-Mir-2-P12b_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- UAUCACAGCCUGCUUGGAUCAGA -57
Get sequence
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