MirGeneDB ID | Agr-Mir-2-P12f1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | West Indian fuzzy chiton (Acanthopleura granulata ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Agr-Mir-2-P12a Agr-Mir-2-P12b Agr-Mir-2-P12c Agr-Mir-2-P12d Agr-Mir-2-P12e Agr-Mir-2-P12f2 Agr-Mir-2-o85 Agr-Mir-2-o86a-v1 Agr-Mir-2-o86a-v2 Agr-Mir-2-o86b Agr-Mir-2-o87-v1 Agr-Mir-2-o87-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cte-Mir-2-P12 Dgr-Mir-2-P12 Efe-Mir-2-P12f Esc-Mir-2-P12 Gsp-Mir-2 Hru-Mir-2-P12 Lhy-Mir-2-P12 Llo-Mir-2-P12 Mgi-Mir-2-P12 Mom-Mir-2-P12f Npo-Mir-2-P12 Obi-Mir-2-P12 Ofu-Mir-2-P12 Ovu-Mir-2-P12 Pau-Mir-2-P12 Pdu-Mir-2-P12 Ple-Mir-2 Pve-Mir-2-P12 Rph-Mir-2-P12 War-Mir-2-P12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | A. granulata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_016165875.1_ASM1616587v1_Acanthopleura_granula) |
JABBOT010000002.1: 46258275-46258333 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGUCAGAUGUACUGCAUGUGAUGGGUAACACUGACCAAGUCUCUGUGGUUUGCUGAUUCUGAUGUCAUAUCACAGCUGCUUGGAUCAGCAUGACGUGUCACAAAUAUCUGCACAUGUGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGUCAGAUGUACUGCAU- G AACA -| CU U CUGAUU GUGAUG GU CUGA CCAAGU CUGUGGU UG \ CACUGU CA GACU GGUUCG GACACUA AC C UGUGUACACGUCUAUAAA G GUAC A^ UC U UGUAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Agr-Mir-2-P12f1_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGACCAAGUCUCUGUGGUUUG -22
Get sequence
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Mature sequence | Agr-Mir-2-P12f1_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UAUCACAGCUGCUUGGAUCAGC -59
Get sequence
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