MirGeneDB ID | Aae-Mir-2-P5a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGGAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-2944b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aae-Mir-2-P1-v1 Aae-Mir-2-P1-v2 Aae-Mir-2-P2b Aae-Mir-2-P3 Aae-Mir-2-P4-v1 Aae-Mir-2-P4-v2 Aae-Mir-2-P5b Aae-Mir-2-P7 Aae-Mir-2-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-2-P5a1 Aga-Mir-2-P5a2 Cel-Mir-2-o5 Dan-Mir-2-P5 Dlo-Mir-2-P5 Dma-Mir-2-P5 Dme-Mir-2-P5 Dmo-Mir-2-P5 Dpu-Mir-2-P5 Dsi-Mir-2-P5 Dya-Mir-2-P5 Gpa-Mir-2-P5-v1 Gpa-Mir-2-P5-v2 Gsp-Mir-2 Ple-Mir-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Culicidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.602: 93656-93722 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P5a) |
Mir-2-P5a
supercont1.602: 93656-93722 [+]
Ensembl
Mir-3-o1a supercont1.602: 94041-94109 [+] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUAACGGUGUCCCGAGAGUGAUCGAAGUUCGAAGGAACUCCCGGUGUGAUAUUCGAAGUUACAAUUGGAUAGCAUAUCACAGCAGUAGUUACCUACCAACUUUGCACUUUGCCAGUCUUCGUCGUCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CUAACGGUGUCCCGAGA---| AU CGA - CCCG - UCGAAGUUAC GUG CGAAGUU AGG AACU G UGUGAUAU \ CAC GUUUCAA UCC UUGA C ACACUAUA A GCUGCUGCUUCUGACCGUUU^ -- CCA A UGA- G CGAUAGGUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aae-Mir-2-P5a_5p |
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mirBase accession | MIMAT0014304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GAAGGAACUCCCGGUGUGAUAUU -23
Get sequence
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Co-mature sequence | Aae-Mir-2-P5a_3p |
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mirBase accession | MIMAT0015373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
44- UAUCACAGCAGUAGUUACCUACC -67
Get sequence
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