MirGeneDB ID | Aae-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aae-Mir-2-P1-v1 Aae-Mir-2-P1-v2 Aae-Mir-2-P2b Aae-Mir-2-P3 Aae-Mir-2-P4-v1 Aae-Mir-2-P4-v2 Aae-Mir-2-P5a Aae-Mir-2-P5b Aae-Mir-2-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-2-P7 Asu-Mir-2-o7a Asu-Mir-2-o7b Bge-Mir-2-P7 Dan-Mir-2-P7 Dlo-Mir-2-P7 Dme-Mir-2-P7 Dmo-Mir-2-P7 Dsi-Mir-2-P7 Dya-Mir-2-P7 Gpa-Mir-2-P7 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P7 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.744: 322020-322083 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P7) |
Mir-2-P7
supercont1.744: 322020-322083 [+]
Ensembl
Mir-29-P2h supercont1.744: 322296-322358 [+] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUCAGGAACAUUGAUGCGAGUAGUGCCGCGCGAGAACUCCGGCUGUGACCUGUGUACACUUUAUCCAAAUCACAUCACAGUCUGAGUUCUUGCUUGGAGGCUCGUCGAUCAACUAAUGGAUCAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GUCAGGAACAUUGAUGC----| AGUG C C CC UACACUU GAGU CCG GCGAGAACUC GGCUGUGA UGUG U CUCG GGU CGUUCUUGAG CUGACACU ACAC A GACUAGGUAAUCAACUAGCUG^ GA-- U U -- UAAACCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aae-Mir-2-P7_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0014241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGAGAACUCCGGCUGUGACCUGUG -24
Get sequence
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Mature sequence | Aae-Mir-2-P7_3p |
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mirBase accession | MIMAT0014242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- CAUCACAGUCUGAGUUCUUGCU -64
Get sequence
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