MirGeneDB ID | Dme-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dme-Mir-2-P1-v1 Dme-Mir-2-P1-v2 Dme-Mir-2-P2a Dme-Mir-2-P2b1 Dme-Mir-2-P2b2 Dme-Mir-2-P3a Dme-Mir-2-P3b Dme-Mir-2-P4a-v1 Dme-Mir-2-P4a-v2 Dme-Mir-2-P4b-v1 Dme-Mir-2-P4b-v2 Dme-Mir-2-P5 Dme-Mir-2-P6a Dme-Mir-2-P6b Dme-Mir-2-P6c Dme-Mir-2-P8-v1 Dme-Mir-2-P8-v2 Dme-Mir-2-P9-v1 Dme-Mir-2-P9-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2-P7 Aga-Mir-2-P7 Asu-Mir-2-o7a Asu-Mir-2-o7b Bge-Mir-2-P7 Dan-Mir-2-P7 Dlo-Mir-2-P7 Dmo-Mir-2-P7 Dsi-Mir-2-P7 Dya-Mir-2-P7 Gpa-Mir-2-P7 Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P7 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3R: 21622503-21622563 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P7) |
Mir-29-P2h
3R: 21621902-21621998 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P7 3R: 21622503-21622563 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCAUUUAGAUCUAUGUGAGGCGCACUUGUCAAGAACUUUCUCUGUGACCCGCGUGUACUUAAAAGCCGCAUCACAGUCUGAGUUCUUGCUGAGUGCGAAAUCCUCGAAGCAACAUUAAGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGCAUUUAGAUCUAUGU- GG-| U UCU CC CGUGUAC GA CGCACUUG CAAGAACUU CUGUGA CG \ CU GCGUGAGU GUUCUUGAG GACACU GC U CGAAUUACAACGAAGCUC AAA^ C UCU AC CGAAAAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-2-P7_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAAGAACUUUCUCUGUGACCCG -22
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-2-P7_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CAUCACAGUCUGAGUUCUUGCU -61
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000116 TargetScanFly: dme-miR-11 |