MirGeneDB ID | Dme-Mir-2-P2b2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-13b-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dme-Mir-2-P1-v1 Dme-Mir-2-P1-v2 Dme-Mir-2-P2a Dme-Mir-2-P2b1 Dme-Mir-2-P3a Dme-Mir-2-P3b Dme-Mir-2-P4a-v1 Dme-Mir-2-P4a-v2 Dme-Mir-2-P4b-v1 Dme-Mir-2-P4b-v2 Dme-Mir-2-P5 Dme-Mir-2-P6a Dme-Mir-2-P6b Dme-Mir-2-P6c Dme-Mir-2-P7 Dme-Mir-2-P8-v1 Dme-Mir-2-P8-v2 Dme-Mir-2-P9-v1 Dme-Mir-2-P9-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-2-P2b Aga-Mir-2-P2b Bge-Mir-2-P2b Dan-Mir-2-P2b2 Dlo-Mir-2-P2b Dma-Mir-2-o2 Dma-Mir-2-P2 Dmo-Mir-2-P2b2 Dpu-Mir-2-o2 Dpu-Mir-2-P2 Dsi-Mir-2-P2b2 Dya-Mir-2-P2b2 Gpa-Mir-2-P2b Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P2b Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 9091237-9091297 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAACAUCGUCUACCUCUGCUGUCUAUUAACGCGUCAAAAUGACUGUGAGCUAUGUGGAUUUGACUUCAUAUCACAGCCAUUUUGACGAGUUUGUUGGACAGCCAGCCUCAUCAACGUGGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AAACAUCGUCUACCUCU-- UU-| G A GC UGGAU GCUGUCUA AAC CGUCAAAAUG CUGUGA UAUG U CGACAGGU UUG GCAGUUUUAC GACACU AUAC U AAGGUGCAACUACUCCGAC UGU^ A C -- UUCAG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-2-P2b2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCGUCAAAAUGACUGUGAGCUAUG -24
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-2-P2b2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAUCACAGCCAUUUUGACGAGUU -61
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000119 TargetScanFly: dme-miR-13b |