| MirGeneDB ID | Dme-Mir-2-P3a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-2b-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dme-Mir-2-P1-v1 Dme-Mir-2-P1-v2 Dme-Mir-2-P2a Dme-Mir-2-P2b1 Dme-Mir-2-P2b2 Dme-Mir-2-P3b Dme-Mir-2-P4a-v1 Dme-Mir-2-P4a-v2 Dme-Mir-2-P4b-v1 Dme-Mir-2-P4b-v2 Dme-Mir-2-P5 Dme-Mir-2-P6a Dme-Mir-2-P6b Dme-Mir-2-P6c Dme-Mir-2-P7 Dme-Mir-2-P8-v1 Dme-Mir-2-P8-v2 Dme-Mir-2-P9-v1 Dme-Mir-2-P9-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-2-P3 Bge-Mir-2-P3 Cbr-Mir-2-o3 Cel-Mir-2-o3 Dan-Mir-2-P3a-v1 Dan-Mir-2-P3a-v2 Dma-Mir-2-P3 Dpu-Mir-2-P3 Dsi-Mir-2-P3a Dya-Mir-2-P3a Hme-Mir-2-P3-v1 Hme-Mir-2-P3-v2 Isc-Mir-2-P3 Tca-Mir-2-P3-v1 Tca-Mir-2-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2L: 8258622-8258684 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCAAAUCAAAAUAACUAAAAACUUCAACUGUCUUCAAAGUGGCAGUGACAUGUUGUCAACAAUAUUCAUAUCACAGCCAGCUUUGAGGAGCGUUGCGGUUUUUCUCGUCCGGCGACUUAAGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCAAAUCAAAAUAACU-- U UG -| A C UUGUCA AAAAACU CAAC UCUUCAAAG UGGC GUGA AUG A UUUUUGG GUUG AGGAGUUUC ACCG CACU UAC C GGAAUUCAGCGGCCUGCUC C CG G^ A A UUAUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-2-P3a_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020782 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUCUUCAAAGUGGCAGUGACAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-2-P3a_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000107 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UAUCACAGCCAGCUUUGAGGAGCG -63
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000107 TargetScanFly: dme-miR-2b |
