MirGeneDB ID | Cfa-Mir-148-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-148 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cfa-mir-152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cfa-Mir-148-P1 Cfa-Mir-148-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-148-P3 Bta-Mir-148-P3 Cja-Mir-148-P3 Cmi-Mir-148-P3 Cpi-Mir-148-P3 Cpo-Mir-148-P3 Dno-Mir-148-P3 Dre-Mir-148-P3 Ebu-Mir-148 Eca-Mir-148-P3 Gmo-Mir-148-P3 Hsa-Mir-148-P3 Laf-Mir-148-P3 Loc-Mir-148-P3 Mal-Mir-148-P3 Mdo-Mir-148-P3 Mml-Mir-148-P3 Mmr-Mir-148-P3 Mmu-Mir-148-P3 Neu-Mir-148-P3 Oan-Mir-148-P3 Ocu-Mir-148-P3 Pab-Mir-148-P3 Rno-Mir-148-P3 Sha-Mir-148-P3 Spt-Mir-148-P3 Sto-Mir-148-P3 Tni-Mir-148-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (canFam3_add) |
chr9: 24335161-24335219 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGAGGCUGGGCGCCGCUGUCCCCCCGGCCCAGGUUCUGUGAUACACUCCGACUCGGGCUCUGGAGCAGUCAGUGCAUGACAGAACUUGGGCCCGGACGGACCUUCUGCACCCAAUGGGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGCUGGGCGCCGCU- C-| C G A CC CGGGCU GUCC CC GGCCCAGGUUCUGU AU CACU GACU \ CAGG GG CCGGGUUCAAGACA UA GUGA CUGA C CGGGUAACCCACGUCUUC CA^ C G C -- CGAGGU 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cfa-Mir-148-P3_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGUUCUGUGAUACACUCCGACU -23
Get sequence
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Mature sequence | Cfa-Mir-148-P3_3p |
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mirBase accession | MIMAT0006738 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UCAGUGCAUGACAGAACUUGG -59
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-152 miRDB: MIMAT0006738 |