MirGeneDB ID | Eba-Mir-10-P5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-10 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UACCCUG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Epimenia (Solenogaster) (Epimenia babai) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Eba-Mir-10-P1 Eba-Mir-10-P2 Eba-Mir-10-P3 Eba-Mir-10-P6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Adi-Mir-10 Agr-Mir-10-P5 Asp-Mir-10 Cte-Mir-10-P5 Efe-Mir-10-P5a Efe-Mir-10-P5b Hru-Mir-10-P5 Lgi-Mir-10-P5 Lhy-Mir-10-P5 Llo-Mir-10-P5a-v1 Llo-Mir-10-P5a-v2 Llo-Mir-10-P5b-v1 Llo-Mir-10-P5b-v2 Llo-Mir-10-P5b-v3 Mgi-Mir-10-P5 Mom-Mir-10-P5 Nve-Mir-10 Ofu-Mir-10-P5 Pau-Mir-10-P5 Pdu-Mir-10-P5 Pve-Mir-10-P5 Rph-Mir-10-P5 Snu-Mir-10-P5 War-Mir-10-P5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Lophotrochozoa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eumetazoa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_011762755.2_ASM1176275v2_Epimenia) |
WURV02098594.1: 2279-2339 [-] Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCGAUGGAAGACAUUAUUGGAGGAACAUUUUUACCCUGUUGAACCGAGCGAGUGGCGUUAUACGAAUCACUGUUCGUUUCCAUGGGUACACAUGUGCGUCCUAAAUGACAUCGCGUAAUCCGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 CCGAUGGAAGACAUUAUU--| GGA UUU UGUU C G GCGUUA GGA ACAU UACCC GAA CGAGC AGUG \ CCU UGUA AUGGG CUU GCUUG UCAC U CCUAAUGCGCUACAGUAAAU^ GCG CAC UAC- U - UAAGCA . 110 100 90 80 70 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Eba-Mir-10-P5_5p |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUACCCUGUUGAACCGAGCGAGUG -24
Get sequence
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Star sequence | Eba-Mir-10-P5_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CUGUUCGUUUCCAUGGGUACAC -61
Get sequence
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