| MirGeneDB ID | Dya-Mir-2-P3b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-2 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUCACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dya-mir-2b-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dya-Mir-2-P1-v1 Dya-Mir-2-P1-v2 Dya-Mir-2-P2a Dya-Mir-2-P2b1 Dya-Mir-2-P2b2 Dya-Mir-2-P3a Dya-Mir-2-P4a-v1 Dya-Mir-2-P4a-v2 Dya-Mir-2-P4b-v1 Dya-Mir-2-P4b-v2 Dya-Mir-2-P5 Dya-Mir-2-P6a Dya-Mir-2-P6b Dya-Mir-2-P6c Dya-Mir-2-P7 Dya-Mir-2-P8 Dya-Mir-2-P9-v1 Dya-Mir-2-P9-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-2-P3 Aga-Mir-2-P3 Bge-Mir-2-P3-v1 Bge-Mir-2-P3-v2 Cbr-Mir-2-o3 Cel-Mir-2-o3 Dan-Mir-2-P3b Dlo-Mir-2-P3-v1 Dlo-Mir-2-P3-v2 Dma-Mir-2-P3 Dme-Mir-2-P3b Dmo-Mir-2-P3b Dpu-Mir-2-P3 Dsi-Mir-2-P3b Gpa-Mir-2-P3b Gsp-Mir-2 Hme-Mir-2-P3-v1 Hme-Mir-2-P3-v2 Isc-Mir-2-P3 Ple-Mir-2 Tca-Mir-2-P3-v1 Tca-Mir-2-P3-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Glossinidae + Drosophilidae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
2R: 6067230-6067298 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2-P3b) |
Mir-2-P4b-v1
2R: 6066569-6066628 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P4b-v2 2R: 6066569-6066628 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P4a-v1 2R: 6066959-6067024 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P4a-v2 2R: 6066959-6067024 [-] UCSC Ensembl Mir-2-P3b 2R: 6067230-6067298 [-] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCAUCAAAUCGAAGCAAGAGAAUUGUGUCAUUCUUCAAAGUGGUUGUGAAAUGUUUGCCUUUUUCUGCCUAUUCAUAUCACAGCCAGCUUUGAGGAGCGACGCGAUGCUCAAGACAAAAAAAAUCGCAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UCAUCAAAUCGAAGCAA-- A A -| A UUUGCCUUU GAG AUUGUGUC UUCUUCAAAG UGGUUGUGA AUG U CUC UAGCGCAG GAGGAGUUUC ACCGACACU UAC U AACGCUAAAAAAAACAGAA G C G^ A UUAUCCGUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Dya-Mir-2-P3b_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCUUCAAAGUGGUUGUGAAAUG -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Dya-Mir-2-P3b_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0009075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
45- UAUCACAGCCAGCUUUGAGGAGCG -69
Get sequence
|
