MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Pmi-Mir-29-P1

Family name MIR-29 (all species)
Seed AGCACCA
Species Bat starfish (Patiria miniata)
MiRBase ID pmi-mir-29a
Paralogues Pmi-Mir-29-P2 
Orthologues Aae-Mir-29-P1  Aca-Mir-29-P1b-v1  Aca-Mir-29-P1b-v2  Aca-Mir-29-P1d-v1  Aca-Mir-29-P1d-v2  Aga-Mir-29-P1  Agr-Mir-29-P1  Ami-Mir-29-P1b-v1  Ami-Mir-29-P1b-v2  Ami-Mir-29-P1d-v1  Ami-Mir-29-P1d-v2  Asu-Mir-29-P1  Bfl-Mir-29-P1  Bge-Mir-29-P1k  Bge-Mir-29-P1l  Bla-Mir-29-P1  Bta-Mir-29-P1b-v1  Bta-Mir-29-P1b-v2  Bta-Mir-29-P1d7-v1  Bta-Mir-29-P1d7-v2  Bta-Mir-29-P1d8-v1  Bta-Mir-29-P1d8-v2  Cbr-Mir-29-P1  Cel-Mir-29-P1  Cfa-Mir-29-P1b-v1  Cfa-Mir-29-P1b-v2  Cfa-Mir-29-P1d-v1  Cfa-Mir-29-P1d-v2  Cin-Mir-29-o1  Cja-Mir-29-P1b-v1  Cja-Mir-29-P1b-v2  Cja-Mir-29-P1d-v1  Cja-Mir-29-P1d-v2  Cli-Mir-29-P1b-v1  Cli-Mir-29-P1b-v2  Cli-Mir-29-P1d-v1  Cli-Mir-29-P1d-v2  Cmi-Mir-29-P1b  Cmi-Mir-29-P1d  Cpi-Mir-29-P1b-v1  Cpi-Mir-29-P1b-v2  Cpi-Mir-29-P1d-v1  Cpi-Mir-29-P1d-v2  Cpo-Mir-29-P1b-v1  Cpo-Mir-29-P1b-v2  Cpo-Mir-29-P1d-v1  Cpo-Mir-29-P1d-v2  Csc-Mir-29-P1  Cte-Mir-29-P1  Dan-Mir-29-P1  Dgr-Mir-29-P1  Dlo-Mir-29-P1  Dma-Mir-29-P1  Dme-Mir-29-P1  Dmo-Mir-29-P1  Dno-Mir-29-P1b-v1  Dno-Mir-29-P1b-v2  Dno-Mir-29-P1d-v1  Dno-Mir-29-P1d-v2  Dpu-Mir-29-P1  Dre-Mir-29-P1b1  Dre-Mir-29-P1d1  Dre-Mir-29-P1d2  Dsi-Mir-29-P1  Dya-Mir-29-P1  Eba-Mir-29-P1  Ebu-Mir-29-P1e  Ebu-Mir-29-P1f  Eca-Mir-29-P1b-v1  Eca-Mir-29-P1b-v2  Eca-Mir-29-P1d-v1  Eca-Mir-29-P1d-v2  Efe-Mir-29-P1i  Efe-Mir-29-P1j  Esc-Mir-29-P1  Ete-Mir-29-P1b-v1  Ete-Mir-29-P1b-v2  Ete-Mir-29-P1d-v1  Ete-Mir-29-P1d-v2  Gga-Mir-29-P1b-v1  Gga-Mir-29-P1b-v2  Gga-Mir-29-P1d-v1  Gga-Mir-29-P1d-v2  Gja-Mir-29-P1b-v1  Gja-Mir-29-P1b-v2  Gja-Mir-29-P1d-v1  Gja-Mir-29-P1d-v2  Gmo-Mir-29-P1b1  Gmo-Mir-29-P1b2  Gmo-Mir-29-P1d1  Gmo-Mir-29-P1d2  Gpa-Mir-29-P1  Gsp-Mir-29  Hme-Mir-29-P1  Hru-Mir-29-P1  Hsa-Mir-29-P1b-v1  Hsa-Mir-29-P1b-v2  Hsa-Mir-29-P1d-v1  Hsa-Mir-29-P1d-v2  Isc-Mir-29-P1  Laf-Mir-29-P1b-v1  Laf-Mir-29-P1b-v2  Laf-Mir-29-P1d-v1  Laf-Mir-29-P1d-v2  Lan-Mir-29-P1g  Lan-Mir-29-P1h  Lch-Mir-29-P1b  Lch-Mir-29-P1d  Lhy-Mir-29-P1  Llo-Mir-29-P1  Loc-Mir-29-P1b-v1  Loc-Mir-29-P1b-v2  Loc-Mir-29-P1d  Lpo-Mir-29-P1m  Lpo-Mir-29-P1n  Mal-Mir-29-P1b1-v1  Mal-Mir-29-P1b1-v2  Mal-Mir-29-P1b2-v1  Mal-Mir-29-P1b2-v2  Mal-Mir-29-P1d1  Mal-Mir-29-P1d2-v1  Mal-Mir-29-P1d2-v2  Mdo-Mir-29-P1b-v1  Mdo-Mir-29-P1b-v2  Mdo-Mir-29-P1d-v1  Mdo-Mir-29-P1d-v2  Mgi-Mir-29-P1  Mml-Mir-29-P1b-v1  Mml-Mir-29-P1b-v2  Mml-Mir-29-P1d-v1  Mml-Mir-29-P1d-v2  Mmr-Mir-29-P1b-v1  Mmr-Mir-29-P1b-v2  Mmr-Mir-29-P1d-v1  Mmr-Mir-29-P1d-v2  Mmu-Mir-29-P1b-v1  Mmu-Mir-29-P1b-v2  Mmu-Mir-29-P1d-v1  Mmu-Mir-29-P1d-v2  Mom-Mir-29-P1  Mun-Mir-29-P1b  Mun-Mir-29-P1d-v1  Mun-Mir-29-P1d-v2  Neu-Mir-29-P1b-v1  Neu-Mir-29-P1b-v2  Npo-Mir-29-P1  Oan-Mir-29-P1b-v1  Oan-Mir-29-P1b-v2  Oan-Mir-29-P1d-v1  Oan-Mir-29-P1d-v2  Obi-Mir-29-P1  Ocu-Mir-29-P1b-v1  Ocu-Mir-29-P1b-v2  Ocu-Mir-29-P1d-v1  Ocu-Mir-29-P1d-v2  Ofu-Mir-29-P1  Ovu-Mir-29-P1  Pab-Mir-29-P1b-v1  Pab-Mir-29-P1b-v2  Pab-Mir-29-P1d-v1  Pab-Mir-29-P1d-v2  Pau-Mir-29-P1  Pbv-Mir-29-P1b-v1  Pbv-Mir-29-P1b-v2  Pbv-Mir-29-P1d-v1  Pbv-Mir-29-P1d-v2  Pcr-Mir-29-P1  Pdu-Mir-29-P1  Pfl-Mir-29-P1  Pma-Mir-29-P1o1  Pma-Mir-29-P1o2  Pve-Mir-29-P1  Rno-Mir-29-P1b-v1  Rno-Mir-29-P1b-v2  Rno-Mir-29-P1d5-v1  Rno-Mir-29-P1d5-v2  Rno-Mir-29-P1d6-v1  Rno-Mir-29-P1d6-v2  Rph-Mir-29-P1  Sha-Mir-29-P1b-v1  Sha-Mir-29-P1b-v2  Sha-Mir-29-P1d-v1  Sha-Mir-29-P1d-v2  Sko-Mir-29-P1  Snu-Mir-29-P1  Spt-Mir-29-P1b  Spt-Mir-29-P1d  Spu-Mir-29-P1  Sro-Mir-29-P1p1  Sro-Mir-29-P1p2  Sto-Mir-29-P1b  Sto-Mir-29-P1d  Tca-Mir-29-P1  Tgu-Mir-29-P1b-v1  Tgu-Mir-29-P1b-v2  Tgu-Mir-29-P1d-v1  Tgu-Mir-29-P1d-v2  Tni-Mir-29-P1b1  Tni-Mir-29-P1b2  Tni-Mir-29-P1d1  Tni-Mir-29-P1d2  Tur-Mir-29-P1  War-Mir-29-P1  Xbo-Mir-29-P1  Xla-Mir-29-P1b3  Xla-Mir-29-P1b4  Xla-Mir-29-P1d3  Xla-Mir-29-P1d4  Xtr-Mir-29-P1b-v1  Xtr-Mir-29-P1b-v2  Xtr-Mir-29-P1d 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(Pmin1)		 JH769952.1: 66752-66814 [-]
Clustered miRNAs
(< 50kb from Mir-29-P1)		 Mir-29-P2 JH769952.1: 63311-63374 [-]
Mir-29-P1 JH769952.1: 66752-66814 [-]
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CCGUUUGCACGCCAUUUGCCAGCCCGAGGCCUGGUUUCAGGUGGUGGAUAGUACCCAGAUUGGAAUGAUCUAAGCACCAGUUGAAAUCAGAGCCUCUGGCGUUGGUCAGUCACAGCCGGACAU
Get precursor sequence
Structure
        10        20          30         40        50        60
CCGUUUGCACGCCAUUUG     -  -     -|         G     GA   UACCCAGA 
                  CCAGC CC GAGGC CUGGUUUCAG UGGUG  UAG        U
                  GGUUG GG CUCCG GACUAAAGUU ACCAC  AUC        U
UACAGGCCGACACUGACU     C  U     A^         G     GA   UAGUAAGG 
 120       110       100        90        80        70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsUG at 5p(-14)
Tissue expression
-   +
Em To
Star sequence

Pmi-Mir-29-P1_5p*
mirBase accessionNone
Sequence 
0- CUGGUUUCAGGUGGUGGAUAG -21
Get sequence
Mature sequence

Pmi-Mir-29-P1_3p
mirBase accessionMIMAT0032145
Sequence 
41- AAGCACCAGUUGAAAUCAGAGC -63
Get sequence