MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Gsp-Mir-29

Family name MIR-29 (all species)
Seed AGCACCA
Species Montseny horsehair worm (Gordionus sp.)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Aae-Mir-29-P1  Aae-Mir-29-P2h  Aca-Mir-29-P1b-v1  Aca-Mir-29-P1b-v2  Aca-Mir-29-P1d-v1  Aca-Mir-29-P1d-v2  Aca-Mir-29-P2b  Aca-Mir-29-P2d  Aga-Mir-29-P1  Aga-Mir-29-P2h  Agr-Mir-29-P1  Agr-Mir-29-P2  Ami-Mir-29-P1b-v1  Ami-Mir-29-P1b-v2  Ami-Mir-29-P1d-v1  Ami-Mir-29-P1d-v2  Ami-Mir-29-P2b  Ami-Mir-29-P2d  Asu-Mir-29-P1  Asu-Mir-29-P2  Ava-Mir-29-o8  Ava-Mir-29-o9  Bfl-Mir-29-P1  Bfl-Mir-29-P2  Bge-Mir-29-P1k  Bge-Mir-29-P1l  Bge-Mir-29-P2g  Bge-Mir-29-P2h  Bla-Mir-29-P1  Bla-Mir-29-P2  Bpl-Mir-29-o3  Bta-Mir-29-P1b-v1  Bta-Mir-29-P1b-v2  Bta-Mir-29-P1d7-v1  Bta-Mir-29-P1d7-v2  Bta-Mir-29-P1d8-v1  Bta-Mir-29-P1d8-v2  Bta-Mir-29-P2b  Bta-Mir-29-P2d7  Bta-Mir-29-P2d8  Cbr-Mir-29-P1  Cbr-Mir-29-P2  Cel-Mir-29-P1  Cel-Mir-29-P2  Cfa-Mir-29-P1b-v1  Cfa-Mir-29-P1b-v2  Cfa-Mir-29-P1d-v1  Cfa-Mir-29-P1d-v2  Cfa-Mir-29-P2b  Cfa-Mir-29-P2d7  Cfa-Mir-29-P2d8  Cin-Mir-29-o1  Cja-Mir-29-P1b-v1  Cja-Mir-29-P1b-v2  Cja-Mir-29-P1d-v1  Cja-Mir-29-P1d-v2  Cja-Mir-29-P2b  Cja-Mir-29-P2d  Cli-Mir-29-P1b-v1  Cli-Mir-29-P1b-v2  Cli-Mir-29-P1d-v1  Cli-Mir-29-P1d-v2  Cli-Mir-29-P2b  Cli-Mir-29-P2d  Cmi-Mir-29-P1b  Cmi-Mir-29-P1d  Cmi-Mir-29-P2a-v1  Cmi-Mir-29-P2a-v2  Cmi-Mir-29-P2b  Cmi-Mir-29-P2d  Cpi-Mir-29-P1b-v1  Cpi-Mir-29-P1b-v2  Cpi-Mir-29-P1d-v1  Cpi-Mir-29-P1d-v2  Cpi-Mir-29-P2b  Cpi-Mir-29-P2d  Cpo-Mir-29-P1b-v1  Cpo-Mir-29-P1b-v2  Cpo-Mir-29-P1d-v1  Cpo-Mir-29-P1d-v2  Cpo-Mir-29-P2b  Cpo-Mir-29-P2d  Csc-Mir-29-P1  Cte-Mir-29-P1  Cte-Mir-29-P2  Dan-Mir-29-P1  Dan-Mir-29-P2g  Dan-Mir-29-P2h  Dgr-Mir-29-P1  Dgr-Mir-29-P2  Dlo-Mir-29-P1  Dma-Mir-29-P1  Dma-Mir-29-P2  Dme-Mir-29-P1  Dme-Mir-29-P2g  Dme-Mir-29-P2h  Dmo-Mir-29-P1  Dmo-Mir-29-P2g  Dmo-Mir-29-P2h  Dno-Mir-29-P1b-v1  Dno-Mir-29-P1b-v2  Dno-Mir-29-P1d-v1  Dno-Mir-29-P1d-v2  Dno-Mir-29-P2b  Dno-Mir-29-P2d  Dpu-Mir-29-P1  Dpu-Mir-29-P2  Dre-Mir-29-P1b1  Dre-Mir-29-P1d1  Dre-Mir-29-P1d2  Dre-Mir-29-P2b1  Dre-Mir-29-P2d2  Dsi-Mir-29-P1  Dsi-Mir-29-P2g  Dsi-Mir-29-P2h  Dya-Mir-29-P1  Dya-Mir-29-P2g  Dya-Mir-29-P2h  Eba-Mir-29-P1  Eba-Mir-29-P2  Ebu-Mir-29-P1e  Ebu-Mir-29-P1f  Ebu-Mir-29-P2e  Ebu-Mir-29-P2f  Eca-Mir-29-P1b-v1  Eca-Mir-29-P1b-v2  Eca-Mir-29-P1d-v1  Eca-Mir-29-P1d-v2  Eca-Mir-29-P2b-v1  Eca-Mir-29-P2b-v2  Eca-Mir-29-P2d7  Eca-Mir-29-P2d8  Efe-Mir-29-P1i  Efe-Mir-29-P1j  Efe-Mir-29-P2k  Efe-Mir-29-P2l  Esc-Mir-29-P1  Esc-Mir-29-P2  Ete-Mir-29-P1b-v1  Ete-Mir-29-P1b-v2  Ete-Mir-29-P1d-v1  Ete-Mir-29-P1d-v2  Ete-Mir-29-P2b  Ete-Mir-29-P2d  Gga-Mir-29-P1b-v1  Gga-Mir-29-P1b-v2  Gga-Mir-29-P1d-v1  Gga-Mir-29-P1d-v2  Gga-Mir-29-P2b  Gga-Mir-29-P2d  Gja-Mir-29-P1b-v1  Gja-Mir-29-P1b-v2  Gja-Mir-29-P1d-v1  Gja-Mir-29-P1d-v2  Gja-Mir-29-P2b  Gja-Mir-29-P2d  Gmo-Mir-29-P1b1  Gmo-Mir-29-P1b2  Gmo-Mir-29-P1d1  Gmo-Mir-29-P1d2  Gmo-Mir-29-P2b1  Gmo-Mir-29-P2d1  Gmo-Mir-29-P2d2  Gpa-Mir-29-P1  Gpa-Mir-29-P2g  Gpa-Mir-29-P2h  Hme-Mir-29-P1  Hme-Mir-29-P2h  Hmi-Mir-29-o4  Hmi-Mir-29-o5a  Hmi-Mir-29-o5b  Hru-Mir-29-P1  Hru-Mir-29-P2  Hsa-Mir-29-P1b-v1  Hsa-Mir-29-P1b-v2  Hsa-Mir-29-P1d-v1  Hsa-Mir-29-P1d-v2  Hsa-Mir-29-P2b  Hsa-Mir-29-P2d  Isc-Mir-29-P1  Laf-Mir-29-P1b-v1  Laf-Mir-29-P1b-v2  Laf-Mir-29-P1d-v1  Laf-Mir-29-P1d-v2  Laf-Mir-29-P2b  Laf-Mir-29-P2d  Lan-Mir-29-P1g  Lan-Mir-29-P1h  Lan-Mir-29-P2i  Lan-Mir-29-P2j  Lch-Mir-29-P1b  Lch-Mir-29-P1d  Lch-Mir-29-P2a  Lch-Mir-29-P2b  Lch-Mir-29-P2d  Lgi-Mir-29-P2  Lhy-Mir-29-P1  Lhy-Mir-29-P2  Llo-Mir-29-P1  Llo-Mir-29-P2  Loc-Mir-29-P1b-v1  Loc-Mir-29-P1b-v2  Loc-Mir-29-P1d  Loc-Mir-29-P2a  Loc-Mir-29-P2b  Loc-Mir-29-P2d-v1  Loc-Mir-29-P2d-v2  Lpo-Mir-29-P1m  Lpo-Mir-29-P1n  Mal-Mir-29-P1b1-v1  Mal-Mir-29-P1b1-v2  Mal-Mir-29-P1b2-v1  Mal-Mir-29-P1b2-v2  Mal-Mir-29-P1d1  Mal-Mir-29-P1d2-v1  Mal-Mir-29-P1d2-v2  Mal-Mir-29-P2b1-v1  Mal-Mir-29-P2b1-v2  Mal-Mir-29-P2d1  Mal-Mir-29-P2d2  Mdo-Mir-29-P1b-v1  Mdo-Mir-29-P1b-v2  Mdo-Mir-29-P1d-v1  Mdo-Mir-29-P1d-v2  Mdo-Mir-29-P2b  Mdo-Mir-29-P2d  Mgi-Mir-29-P1  Mgi-Mir-29-P2  Mml-Mir-29-P1b-v1  Mml-Mir-29-P1b-v2  Mml-Mir-29-P1d-v1  Mml-Mir-29-P1d-v2  Mml-Mir-29-P2b  Mml-Mir-29-P2d  Mmr-Mir-29-P1b-v1  Mmr-Mir-29-P1b-v2  Mmr-Mir-29-P1d-v1  Mmr-Mir-29-P1d-v2  Mmr-Mir-29-P2b-v1  Mmr-Mir-29-P2b-v2  Mmr-Mir-29-P2d  Mmu-Mir-29-P1b-v1  Mmu-Mir-29-P1b-v2  Mmu-Mir-29-P1d-v1  Mmu-Mir-29-P1d-v2  Mmu-Mir-29-P2b  Mmu-Mir-29-P2d  Mom-Mir-29-P1  Mom-Mir-29-P2  Mun-Mir-29-P1b  Mun-Mir-29-P1d-v1  Mun-Mir-29-P1d-v2  Mun-Mir-29-P2b  Mun-Mir-29-P2d  Neu-Mir-29-P1b-v1  Neu-Mir-29-P1b-v2  Neu-Mir-29-P2b  Neu-Mir-29-P2d  Npo-Mir-29-P1  Npo-Mir-29-P2  Oan-Mir-29-P1b-v1  Oan-Mir-29-P1b-v2  Oan-Mir-29-P1d-v1  Oan-Mir-29-P1d-v2  Oan-Mir-29-P2b  Oan-Mir-29-P2d  Obi-Mir-29-P1  Obi-Mir-29-P2  Ocu-Mir-29-P1b-v1  Ocu-Mir-29-P1b-v2  Ocu-Mir-29-P1d-v1  Ocu-Mir-29-P1d-v2  Ocu-Mir-29-P2b  Ocu-Mir-29-P2d  Ofu-Mir-29-P1  Ofu-Mir-29-P2  Ovu-Mir-29-P1  Ovu-Mir-29-P2  Pab-Mir-29-P1b-v1  Pab-Mir-29-P1b-v2  Pab-Mir-29-P1d-v1  Pab-Mir-29-P1d-v2  Pab-Mir-29-P2b  Pab-Mir-29-P2d  Pau-Mir-29-P1  Pau-Mir-29-P2  Pbv-Mir-29-P1b-v1  Pbv-Mir-29-P1b-v2  Pbv-Mir-29-P1d-v1  Pbv-Mir-29-P1d-v2  Pbv-Mir-29-P2b  Pbv-Mir-29-P2d  Pca-Mir-29-o6  Pca-Mir-29-o7  Pcr-Mir-29-P1  Pcr-Mir-29-P2  Pdu-Mir-29-P1  Pdu-Mir-29-P2  Pfl-Mir-29-P1  Pfl-Mir-29-P2  Pma-Mir-29-P1o1  Pma-Mir-29-P1o2  Pma-Mir-29-P2o1  Pma-Mir-29-P2o2  Pmi-Mir-29-P1  Pmi-Mir-29-P2  Pve-Mir-29-P1  Pve-Mir-29-P2  Rno-Mir-29-P1b-v1  Rno-Mir-29-P1b-v2  Rno-Mir-29-P1d5-v1  Rno-Mir-29-P1d5-v2  Rno-Mir-29-P1d6-v1  Rno-Mir-29-P1d6-v2  Rno-Mir-29-P2b  Rno-Mir-29-P2d5  Rno-Mir-29-P2d6  Rph-Mir-29-P1  Rph-Mir-29-P2  Sha-Mir-29-P1b-v1  Sha-Mir-29-P1b-v2  Sha-Mir-29-P1d-v1  Sha-Mir-29-P1d-v2  Sha-Mir-29-P2b  Sha-Mir-29-P2d  Sko-Mir-29-P1  Sko-Mir-29-P2  Sme-Mir-29-o2  Snu-Mir-29-P1  Snu-Mir-29-P2q  Snu-Mir-29-P2r  Spt-Mir-29-P1b  Spt-Mir-29-P1d  Spt-Mir-29-P2b  Spt-Mir-29-P2d  Spu-Mir-29-P1  Spu-Mir-29-P2  Sro-Mir-29-P1p1  Sro-Mir-29-P1p2  Sro-Mir-29-P2p1  Sro-Mir-29-P2p2  Sto-Mir-29-P1b  Sto-Mir-29-P1d  Sto-Mir-29-P2b  Sto-Mir-29-P2d  Tca-Mir-29-P1  Tca-Mir-29-P2g  Tca-Mir-29-P2h  Tgu-Mir-29-P1b-v1  Tgu-Mir-29-P1b-v2  Tgu-Mir-29-P1d-v1  Tgu-Mir-29-P1d-v2  Tgu-Mir-29-P2b  Tgu-Mir-29-P2d  Tni-Mir-29-P1b1  Tni-Mir-29-P1b2  Tni-Mir-29-P1d1  Tni-Mir-29-P1d2  Tni-Mir-29-P2b1  Tni-Mir-29-P2d1  Tni-Mir-29-P2d2  Tur-Mir-29-P1  War-Mir-29-P1  War-Mir-29-P2  Xbo-Mir-29-P1  Xbo-Mir-29-P2  Xla-Mir-29-P1b3  Xla-Mir-29-P1b4  Xla-Mir-29-P1d3  Xla-Mir-29-P1d4  Xla-Mir-29-P2b3  Xla-Mir-29-P2b4  Xla-Mir-29-P2d3  Xla-Mir-29-P2d4  Xtr-Mir-29-P1b-v1  Xtr-Mir-29-P1b-v2  Xtr-Mir-29-P1d  Xtr-Mir-29-P2b  Xtr-Mir-29-P2d 
Node of Origin (locus) Bilateria
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(GCA_954871325.1_tfGorGonz1-WG_genomic)		 OX940783.1: 11643377-11643440 [+]
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GAUACAGAAGAGUUAGUUAAUACUUGAUAAACUGAAUUCUUUUGAUAGCCAGAUUGAGUAAAAAAAAAUUUCUAGCACCAUUCGAAUUCAGUAUUACCGAUAUUAAAACUUACUAUGUUCAAUA
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30         40        50        60  
GAUACAGAAGAGUUAGU--|    C   A   -         UUU  AUA  C   UUGAGUAA 
                   UAAUA UUG UAA ACUGAAUUC   UG   GC AGA        \
                   AUUAU AGC AUU UGACUUAAG   AC   CG UCU        A
AUAACUUGUAUCAUUCAAA^    -   C   A         CUU  CA-  A   UUAAAAAA 
  120       110        100        90        80         70
Deep sequencing
3' NTU No
MotifsNo
Tissue expression
-   +
Wh Wh
Star sequence

Gsp-Mir-29_5p* (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- ACUGAAUUCUUUUGAUAGCCAGA -23
Get sequence
Mature sequence

Gsp-Mir-29_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
42- UAGCACCAUUCGAAUUCAGUAU -64
Get sequence