MirGeneDB 3.0
49 microRNA genes with node of origin T. urticae
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Tur-Mir-2-o142a tur-mir-2-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0023042 MIMAT0023043 HE587310.1 2525606 2525669 + T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-2-o142b tur-mir-2-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0023042 MIMAT0023043 HE587310.1 2523054 2523117 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-2-o143 None MIR-2 AUCACAG None None HE587302.1 3261040 3261110 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-7-P28 tur-mir-7 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0023036 MIMAT0023037 HE587302.1 1216514 1216576 - T. urticae Bilateria No 1
Tur-Mir-7-P29 None MIR-7 GGAAGAC None None HE587312.1 2160396 2160460 - T. urticae Bilateria Unknown 1 1
Tur-Mir-10-P1y None MIR-10 CUCUGUA None None HE587311.1 780226 780287 - T. urticae Eumetazoa No 1
Tur-Mir-10-P1z-v1 tur-mir-10 MIR-10 CCCUGUA MIMAT0023026 MIMAT0023027 HE587320.1 1111621 1111681 + T. urticae Eumetazoa No
Tur-Mir-10-P1z-v2 tur-mir-10 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023026 MIMAT0023027 HE587320.1 1111620 1111682 + T. urticae Eumetazoa No 1
Tur-Mir-10-P4u tur-mir-993b MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023052 MIMAT0023053 HE587311.1 2466151 2466214 - T. urticae Eumetazoa No
Tur-Mir-10-P4v tur-mir-993a-2 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023058 MIMAT0023059 HE587311.1 2465365 2465427 - T. urticae Eumetazoa No 1
Tur-Mir-10-P4w tur-mir-993a-1 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023058 MIMAT0023059 HE587311.1 2464812 2464873 - T. urticae Eumetazoa No
Tur-Mir-12-P14 tur-mir-12a MIR-12 GAGUAUU MIMAT0023102 MIMAT0023103 HE587328.1 1008240 1008300 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-12-P15 tur-mir-12b MIR-12 GAGUAUU MIMAT0023044 MIMAT0023045 HE587311.1 1901159 1901218 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-36-P30 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096172 1096231 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P31 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096273 1096332 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P32 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096476 1096535 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P33 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096578 1096637 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P34 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096882 1096941 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P35 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096984 1097043 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P36 None MIR-36 CACCGGG None None HE587309.1 1097086 1097144 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-71-P6a tur-mir-71-1 MIR-71 CUCACUA MIMAT0023040 MIMAT0023041 HE587310.1 2524818 2524890 + T. urticae Nephrozoa No 1
Tur-Mir-71-P6b tur-mir-71-2 MIR-71 CUCACUA MIMAT0023040 MIMAT0023041 HE587310.1 2523836 2523908 - T. urticae Nephrozoa No 1
Tur-Mir-87-o38 None MIR-87 UGAGCAA None None HE587301.1 4415425 4415497 - T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-87-o39 tur-mir-87 MIR-87 AGCCGGA MIMAT0023066 MIMAT0023067 HE587301.1 4415225 4415289 - T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-87-o40 None MIR-87 UGAGCAA None None HE587301.1 4415090 4415158 - T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-87-o41 None MIR-87 UGAGCAA None None HE587301.1 4414906 4414965 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-92-P21 None MIR-92 AUUGCAC None None HE587307.1 1360151 1360224 + T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-92-P22 None MIR-92 AUUGCAC None None HE587304.1 3805132 3805205 - T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-92-P23 tur-mir-92 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0023086 MIMAT0023087 HE587317.1 1593042 1593106 + T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-124-P46 tur-mir-124-1 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0023088 MIMAT0023089 HE587309.1 2159035 2159097 + T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-124-P47 tur-mir-124-2 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0026457 MIMAT0023089 HE587309.1 2159846 2159908 + T. urticae Bilateria No 1
Tur-Mir-210-P21 None MIR-210 UGUGCGU None None HE587323.1 68257 68325 + T. urticae Bilateria No 1 1
Tur-Mir-210-P22 None MIR-210 UGUGCGU None None HE587323.1 74280 74348 - T. urticae Bilateria No 1 1
Tur-Mir-279-P26 None MIR-279 GACUAGA None None HE587309.1 1091933 1091994 + T. urticae Protostomia No 1 1 1
Tur-Mir-279-P27a tur-mir-279 MIR-279 GACUAGA MIMAT0023106 MIMAT0023107 HE587308.1 2468600 2468662 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-279-P27b tur-mir-279 MIR-279 GACUAGA MIMAT0023106 MIMAT0023107 HE587308.1 2463767 2463829 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-5731-P1a tur-mir-5731 MIR-5731 UGGGCAC MIMAT0023056 MIMAT0023057 HE587494.1 1952 2039 - T. urticae T. urticae No 1 1
Tur-Mir-5731-P1b tur-mir-5731 MIR-5731 UGGGCAC MIMAT0023056 MIMAT0023057 HE587494.1 6201 6288 - T. urticae T. urticae No 1 1
Tur-Mir-5731-P1c tur-mir-5731 MIR-5731 UGGGCAC MIMAT0023056 MIMAT0023057 HE587301.1 1420763 1420850 - T. urticae T. urticae No 1 1
Tur-Mir-5733 tur-mir-5733 MIR-5733 ACUUGAU MIMAT0023064 MIMAT0023065 HE587301.1 1416967 1417036 - T. urticae T. urticae No 1
Tur-Mir-5734 tur-mir-5734 MIR-5734 UGGGGUA MIMAT0023074 MIMAT0023075 HE587301.1 1423018 1423077 - T. urticae T. urticae No
Tur-Mir-5736-v1 tur-mir-5736a MIR-5736 UUCGCCA MIMAT0023100 MIMAT0023101 HE587301.1 1424674 1424736 - T. urticae T. urticae No
Tur-Mir-5736-v2 tur-mir-5736a MIR-5736 UGCGGAG MIMAT0023100 MIMAT0023101 HE587301.1 1424673 1424737 - T. urticae T. urticae No
Tur-Mir-5738 tur-mir-5738 MIR-5738 AUGUAAU MIMAT0023110 MIMAT0023111 HE587302.1 4314298 4314360 - T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-1 None TUR-NOVEL-1 CGGAUUG None None HE587302.1 6079671 6079731 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-2 None TUR-NOVEL-2 UCACAAC None None HE587314.1 2074896 2074957 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-3 None TUR-NOVEL-3 AUAAAAU None None HE587303.1 2777364 2777427 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-4 None TUR-NOVEL-4 AGGAAAG None None HE587327.1 533052 533118 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-5 None TUR-NOVEL-5 ACCGGGA None None HE587309.1 1096052 1096111 + T. urticae T. urticae No 1 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all