Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
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MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | To | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Bantam | None | BANTAM | GAGAUCA | None | None | JALGQA010000011.1 | 21773818 | 21773879 | - | Protostomia | Protostomia | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Let-7 | None | LET-7 | GAGGUAG | None | None | JALGQA010000018.1 | 20624325 | 20624393 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1 | None | MIR-1 | GGAAUGU | None | None | JALGQA010000002.1 | 71361077 | 71361137 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2-o51 | None | MIR-2 | AUCACAG | None | None | JALGQA010000019.1 | 17033823 | 17033880 | + | H. rufescens | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2-o52 | None | MIR-2 | AUCACAG | None | None | JALGQA010000019.1 | 17033972 | 17034029 | + | H. rufescens | Protostomia | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2-o53 | None | MIR-2 | AUCACAG | None | None | JALGQA010000019.1 | 17034102 | 17034159 | + | H. rufescens | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2-o54 | None | MIR-2 | AUCACAG | None | None | JALGQA010000019.1 | 17034273 | 17034331 | + | H. rufescens | Protostomia | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2-o55 | None | MIR-2 | CACAGCC | None | None | JALGQA010000019.1 | 17033087 | 17033148 | + | H. rufescens | Protostomia | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2-P12 | None | MIR-2 | AUCACAG | None | None | JALGQA010000019.1 | 17033706 | 17033763 | + | Lophotrochozoa | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-7 | None | MIR-7 | GGAAGAC | None | None | JALGQA010000001.1 | 85943714 | 85943772 | - | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-8 | None | MIR-8 | AAUACUG | None | None | JALGQA010000013.1 | 11406604 | 11406664 | + | Bilateria | Nephrozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-9 | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | JALGQA010000001.1 | 86779108 | 86779169 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-10-P1 | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | JALGQA010000004.1 | 46349511 | 46349570 | - | Bilateria | Eumetazoa | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-10-P2 | None | MIR-10 | ACCCGUA | None | None | JALGQA010000018.1 | 20623900 | 20623958 | + | Bilateria | Eumetazoa | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-10-P3 | None | MIR-10 | CCCUGAG | None | None | JALGQA010000018.1 | 20644304 | 20644359 | + | Bilateria | Eumetazoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-10-P5 | None | MIR-10 | UACCCUG | None | None | JALGQA010000004.1 | 46892451 | 46892509 | - | Lophotrochozoa | Eumetazoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-10-P6 | None | MIR-10 | UUACCCU | None | None | JALGQA010000004.1 | 47418182 | 47418242 | - | Neotrochozoa | Eumetazoa | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-12 | None | MIR-12 | GAGUAUU | None | None | JALGQA010000003.1 | 15756156 | 15756212 | + | Protostomia | Protostomia | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-22-P1 | None | MIR-22 | GCUGCCU | None | None | JALGQA010000015.1 | 6470982 | 6471039 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-22-P2 | None | MIR-22 | AGCUGCC | None | None | JALGQA010000015.1 | 6470641 | 6470697 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-29-P1 | None | MIR-29 | AGCACCA | None | None | JALGQA010000023.1 | 6512892 | 6512951 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-29-P2 | None | MIR-29 | AGCACCA | None | None | JALGQA010000023.1 | 6493865 | 6493921 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-31 | None | MIR-31 | GGCAAGA | None | None | JALGQA010000002.1 | 3146529 | 3146590 | + | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-33 | None | MIR-33 | UGCAUUG | None | None | JALGQA010000007.1 | 6957478 | 6957536 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-34 | None | MIR-34 | GGCAGUG | None | None | JALGQA010000024.1 | 8020798 | 8020855 | + | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-67 | None | MIR-67 | CACAACC | None | None | JALGQA010000015.1 | 13313867 | 13313924 | - | Protostomia | Protostomia | Yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-71 | None | MIR-71 | GAAAGAC | None | None | JALGQA010000019.1 | 17032907 | 17032964 | + | Bilateria | Nephrozoa | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-76 | None | MIR-76 | UCGUUGU | None | None | JALGQA010000007.1 | 30148491 | 30148553 | - | Bilateria | Nephrozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-87-P1 | None | MIR-87 | UGAGCAA | None | None | JALGQA010000010.1 | 16274339 | 16274397 | - | Protostomia | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-87-P2 | None | MIR-87 | UGAGCAA | None | None | JALGQA010000010.1 | 16273794 | 16273851 | - | Protostomia | Protostomia | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-92-o92 | None | MIR-92 | AUUGCAC | None | None | JALGQA010000014.1 | 5911876 | 5911932 | + | H. rufescens | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-92-o93 | None | MIR-92 | AUUGCAC | None | None | JALGQA010000014.1 | 5912798 | 5912858 | + | H. rufescens | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-92-o94 | None | MIR-92 | AUUGCAC | None | None | JALGQA010000014.1 | 5917110 | 5917167 | + | H. rufescens | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-92-o95 | None | MIR-92 | AUUGCAC | None | None | JALGQA010000014.1 | 5919490 | 5919546 | + | H. rufescens | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-96-P1h | None | MIR-96 | UUGGCAC | None | None | JALGQA010000005.1 | 37628522 | 37628580 | + | Mollusca | Bilateria | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-96-P1i | None | MIR-96 | UUUGGCA | None | None | JALGQA010000002.1 | 5850784 | 5850843 | - | Mollusca | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-96-P2 | None | MIR-96 | UUGGCAC | None | None | JALGQA010000016.1 | 20461578 | 20461638 | - | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-96-P3 | None | MIR-96 | AUGGCAC | None | None | JALGQA010000016.1 | 20462852 | 20462910 | - | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-124 | None | MIR-124 | AAGGCAC | None | None | JALGQA010000002.1 | 45546777 | 45546833 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-133 | None | MIR-133 | UGGUCCC | None | None | JALGQA010000002.1 | 71378516 | 71378579 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-137 | None | MIR-137 | AUUGCUU | None | None | JALGQA010000002.1 | 14003426 | 14003485 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-153 | None | MIR-153 | UGCAUAG | None | None | JALGQA010000010.1 | 15684730 | 15684789 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-184-o5 | None | MIR-184 | GGACGGA | None | None | JALGQA010000014.1 | 18032507 | 18032564 | - | H. rufescens | Nephrozoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-184-o6 | None | MIR-184 | GGACGGA | None | None | JALGQA010000014.1 | 18030619 | 18030676 | - | H. rufescens | Nephrozoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-190 | None | MIR-190 | GAUAUGU | None | None | JALGQA010000014.1 | 4501139 | 4501198 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-193-P1 | None | MIR-193 | ACUGGCC | None | None | JALGQA010000011.1 | 1100867 | 1100926 | + | Bilateria | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-193-P2 | None | MIR-193 | AAUGCCC | None | None | JALGQA010000011.1 | 1140061 | 1140121 | + | Bilateria | Bilateria | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-210-P23 | None | MIR-210 | UGUGCGU | None | None | JALGQA010000006.1 | 28697465 | 28697524 | + | H. rufescens | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-210-P24 | None | MIR-210 | UGUGCGU | None | None | JALGQA010000006.1 | 28646002 | 28646060 | + | H. rufescens | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-216-P1 | None | MIR-216 | AAUAUCA | None | None | JALGQA010000003.1 | 15754732 | 15754788 | + | Bilateria | Nephrozoa | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-216-P2d | None | MIR-216 | AAUCUCA | None | None | JALGQA010000003.1 | 15755123 | 15755181 | + | Lophotrochozoa | Nephrozoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-219 | None | MIR-219 | GAUUGUC | None | None | JALGQA010000008.1 | 1926308 | 1926366 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-242-P3a | None | MIR-242 | UGCGUAG | None | None | JALGQA010000016.1 | 16932597 | 16932652 | - | H. rufescens | Nephrozoa | Unknown | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-242-P3b | None | MIR-242 | UGCGUAG | None | None | JALGQA010000016.1 | 16931077 | 16931132 | - | H. rufescens | Nephrozoa | Unknown | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-252-P1 | None | MIR-252 | UAAGUAG | None | None | JALGQA010000012.1 | 1914945 | 1915000 | - | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-252-P2 | None | MIR-252 | UAAGUAC | None | None | JALGQA010000012.1 | 1902167 | 1902227 | - | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-277 | None | MIR-277 | AAAUGCA | None | None | JALGQA010000024.1 | 8013843 | 8013905 | + | Protostomia | Protostomia | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-278 | None | MIR-278 | CGGUGGG | None | None | JALGQA010000021.1 | 5285856 | 5285912 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-279 | None | MIR-279 | GACUAGA | None | None | JALGQA010000001.1 | 13045350 | 13045406 | + | Protostomia | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-281 | None | MIR-281 | AGGGAGC | None | None | JALGQA010000031.1 | 5778555 | 5778611 | + | Bilateria | Nephrozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-315 | None | MIR-315 | UUUGAUU | None | None | JALGQA010000016.1 | 20364459 | 20364520 | + | Bilateria | Nephrozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-317 | None | MIR-317 | GAACACA | None | None | JALGQA010000024.1 | 7998742 | 7998801 | + | Protostomia | Protostomia | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-375 | None | MIR-375 | UUGUUCG | None | None | JALGQA010000010.1 | 34490583 | 34490641 | + | Bilateria | Nephrozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-750 | None | MIR-750 | CAGAUCU | None | None | JALGQA010000002.1 | 36159394 | 36159452 | + | Protostomia | Protostomia | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1175 | None | MIR-1175 | GUGGAGA | None | None | JALGQA010000002.1 | 36169534 | 36169592 | + | Protostomia | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1984-P1 | None | MIR-1984 | GCCCUAU | None | None | JALGQA010000013.1 | 5722214 | 5722269 | - | Gastropoda + Bivalvia + Scaphopoda | Conchifera | Unknown | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1984-P2 | None | MIR-1984 | GCCAUUU | None | None | JALGQA010000013.1 | 5718775 | 5718831 | - | Gastropoda + Bivalvia + Scaphopoda | Conchifera | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1986-P1 | None | MIR-1986 | GGAUUUC | None | None | JALGQA010000006.1 | 52828715 | 52828771 | - | H. rufescens | Lophotrochozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1986-P2 | None | MIR-1986 | GGAUUUC | None | None | JALGQA010000006.1 | 52827721 | 52827778 | - | H. rufescens | Lophotrochozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1988 | None | MIR-1988 | GUGGUUU | None | None | JALGQA010000010.1 | 9665708 | 9665765 | - | Gastropoda | Gastropoda | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1989-P4a | None | MIR-1989 | CAGCUGU | None | None | JALGQA010000006.1 | 51473548 | 51473604 | - | H. rufescens | Platytrochozoa | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1989-P4b | None | MIR-1989 | CAGCUGU | None | None | JALGQA010000006.1 | 51636455 | 51636511 | - | H. rufescens | Platytrochozoa | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1990-P2 | None | MIR-1990 | GGGACUA | None | None | JALGQA010000006.1 | 52829075 | 52829131 | - | Lophotrochozoa | Lophotrochozoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1992 | None | MIR-1992 | CAGCAGU | None | None | JALGQA010000004.1 | 53166576 | 53166639 | + | Platytrochozoa | Platytrochozoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1993 | None | MIR-1993 | AUUAUGC | None | None | JALGQA010000002.1 | 73340609 | 73340668 | - | Protostomia | Protostomia | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1994-P1 | None | MIR-1994 | GAGACAG | None | None | JALGQA010000042.1 | 3513498 | 3513556 | + | Mollusca | Lophotrochozoa | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-1994-P2 | None | MIR-1994 | GAGACAG | None | None | JALGQA010000042.1 | 3514060 | 3514117 | + | Mollusca | Lophotrochozoa | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2001 | None | MIR-2001 | UGUGACC | None | None | JALGQA010000012.1 | 1918026 | 1918084 | - | Bilateria | Bilateria | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-2722 | None | MIR-2722 | GGCGCCG | None | None | JALGQA010000020.1 | 4292711 | 4292766 | - | Mollusca | Mollusca | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Mir-12588 | None | MIR-12588 | GUGAUAG | None | None | gb|JALGQB010000184.1|:58662-58925 | 102 | 160 | - | Gastropoda | Gastropoda | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Novel-1 | None | HRU-NOVEL-1 | UUUUUAC | None | None | JALGQA010000055.1 | 1701472 | 1701529 | - | H. rufescens | H. rufescens | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Novel-2 | None | HRU-NOVEL-2 | ACUCCCG | None | None | gb|JALGQB010000024.1|:6030563-6030826 | 91 | 144 | + | H. rufescens | H. rufescens | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hru-Novel-3 | None | HRU-NOVEL-3 | GGUCAGU | None | None | JALGQA010000021.1 | 12337555 | 12337613 | - | H. rufescens | H. rufescens | Unknown | 1 |
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