MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Eba-Mir-36

Family name MIR-36 (all species)
Seed CACCGGG
Species Epimenia (Solenogaster) (Epimenia babai)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Agr-Mir-36  Asu-Mir-36-o27  Asu-Mir-36-o28  Asu-Mir-36-o29-v1  Asu-Mir-36-o29-v2  Asu-Mir-36-o30  Asu-Mir-36-o31  Asu-Mir-36-o32  Ava-Mir-36-P26a  Ava-Mir-36-P26b  Ava-Mir-36-P27  Ava-Mir-36-P28a  Ava-Mir-36-P28b  Ava-Mir-36-P29a  Ava-Mir-36-P29b  Bge-Mir-36  Bko-Mir-36-P16a  Bko-Mir-36-P16b  Bko-Mir-36-P18a  Bko-Mir-36-P18b  Bpl-Mir-36-P16  Bpl-Mir-36-P17  Bpl-Mir-36-P18  Cbr-Mir-36-o1  Cbr-Mir-36-o2  Cbr-Mir-36-o3  Cbr-Mir-36-o4  Cbr-Mir-36-o5  Cbr-Mir-36-o6  Cbr-Mir-36-o7a  Cbr-Mir-36-o7b  Cbr-Mir-36-o7c  Cbr-Mir-36-o8a  Cbr-Mir-36-o8b  Cbr-Mir-36-o8c  Cbr-Mir-36-o9  Cbr-Mir-36-o10  Cbr-Mir-36-o11  Cbr-Mir-36-o12  Cbr-Mir-36-o13  Cbr-Mir-36-o14  Cbr-Mir-36-o15  Cbr-Mir-36-o16  Cbr-Mir-36-o17  Cbr-Mir-36-o18  Cbr-Mir-36-o19  Cbr-Mir-36-o20  Cbr-Mir-36-o21  Cbr-Mir-36-o22  Cbr-Mir-36-o23  Cbr-Mir-36-o24  Cbr-Mir-36-o25  Cbr-Mir-36-o26  Cel-Mir-36-P1  Cel-Mir-36-P2  Cel-Mir-36-P3  Cel-Mir-36-P4  Cel-Mir-36-P5  Cel-Mir-36-P6  Cel-Mir-36-P7  Cel-Mir-36-P8  Cte-Mir-36  Dgr-Mir-36  Dlo-Mir-36  Dma-Mir-36  Dpu-Mir-36  Efe-Mir-36-P9  Efe-Mir-36-P10  Egr-Mir-36-o36  Egr-Mir-36-o37  Esc-Mir-36-P14  Esc-Mir-36-P15  Gsa-Mir-36-o38  Gsa-Mir-36-o39  Gsp-Mir-36  Isc-Mir-36  Lhy-Mir-36  Llo-Mir-36  Lpo-Mir-36-P11  Lpo-Mir-36-P12  Lpo-Mir-36-P13  Mgi-Mir-36  Mom-Mir-36  Npo-Mir-36  Obi-Mir-36-P14  Obi-Mir-36-P15  Ofu-Mir-36  Ovu-Mir-36-P14  Ovu-Mir-36-P15  Pau-Mir-36  Pca-Mir-36-P23  Pca-Mir-36-P24  Pca-Mir-36-P25  Pcr-Mir-36  Pdu-Mir-36  Pve-Mir-36  Rph-Mir-36  Sma-Mir-36-o33  Sma-Mir-36-o34  Sma-Mir-36-o35  Sme-Mir-36-P19  Sme-Mir-36-P20a  Sme-Mir-36-P20b  Sne-Mir-36-P21  Sne-Mir-36-P22  Snu-Mir-36  Tca-Mir-36  Tur-Mir-36-P30  Tur-Mir-36-P31  Tur-Mir-36-P32  Tur-Mir-36-P33  Tur-Mir-36-P34  Tur-Mir-36-P35  Tur-Mir-36-P36  War-Mir-36 
Node of Origin (locus) Protostomia
Node of Origin (family) Protostomia
Genome context
(GCA_011762755.2_ASM1176275v2_Epimenia)		 WURV02176288.1: 5998-6052 [+] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
GUCAUGGCGGCAUGUCUCUAUCUAACUUGGUUGAUGUUUGCCGGGUUAUGUGGUUACGCUAUCAUCACCGGGUAAACAUUCAUCCGCGAACGAUAGUUGUUUACGUCCAACGAAG
Get precursor sequence
Structure
        10          20        30         40        50      
GUCAUGGCGGCAUGUCU--     UAACU   U  -|        G   U   UGGUU 
                   CUAUC     UGG UG AUGUUUGCC GGU AUG     A
                   GAUAG     GCC AC UACAAAUGG CCA UAC     C
GAAGCAACCUGCAUUUGUU     CAAGC   U  U^        G   C   UAUCG 
   110       100        90        80        70        60
Deep sequencing
3' NTU Unknown
MotifsNo
Tissue expression
-   +
Ch
Star sequence

Eba-Mir-36_5p* (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- UUGAUGUUUGCCGGGUUAUG -20
Get sequence
Mature sequence

Eba-Mir-36_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
34- UCACCGGGUAAACAUUCAUCC -55
Get sequence