MirGeneDB 3.0
MirGeneDB ID

Pau-Mir-36

Family name MIR-36 (all species)
Seed CACCGGG
Species Horseshoe worm (Phoronis australis)
MiRBase ID
Paralogues
Orthologues Agr-Mir-36  Asu-Mir-36-o27  Asu-Mir-36-o28  Asu-Mir-36-o29-v1  Asu-Mir-36-o29-v2  Asu-Mir-36-o30  Asu-Mir-36-o31  Asu-Mir-36-o32  Ava-Mir-36-P26a  Ava-Mir-36-P26b  Ava-Mir-36-P27  Ava-Mir-36-P28a  Ava-Mir-36-P28b  Ava-Mir-36-P29a  Ava-Mir-36-P29b  Bge-Mir-36  Bko-Mir-36-P16a  Bko-Mir-36-P16b  Bko-Mir-36-P18a  Bko-Mir-36-P18b  Bpl-Mir-36-P16  Bpl-Mir-36-P17  Bpl-Mir-36-P18  Cbr-Mir-36-o1  Cbr-Mir-36-o2  Cbr-Mir-36-o3  Cbr-Mir-36-o4  Cbr-Mir-36-o5  Cbr-Mir-36-o6  Cbr-Mir-36-o7a  Cbr-Mir-36-o7b  Cbr-Mir-36-o7c  Cbr-Mir-36-o8a  Cbr-Mir-36-o8b  Cbr-Mir-36-o8c  Cbr-Mir-36-o9  Cbr-Mir-36-o10  Cbr-Mir-36-o11  Cbr-Mir-36-o12  Cbr-Mir-36-o13  Cbr-Mir-36-o14  Cbr-Mir-36-o15  Cbr-Mir-36-o16  Cbr-Mir-36-o17  Cbr-Mir-36-o18  Cbr-Mir-36-o19  Cbr-Mir-36-o20  Cbr-Mir-36-o21  Cbr-Mir-36-o22  Cbr-Mir-36-o23  Cbr-Mir-36-o24  Cbr-Mir-36-o25  Cbr-Mir-36-o26  Cel-Mir-36-P1  Cel-Mir-36-P2  Cel-Mir-36-P3  Cel-Mir-36-P4  Cel-Mir-36-P5  Cel-Mir-36-P6  Cel-Mir-36-P7  Cel-Mir-36-P8  Cte-Mir-36  Dgr-Mir-36  Dlo-Mir-36  Dma-Mir-36  Dpu-Mir-36  Eba-Mir-36  Efe-Mir-36-P9  Efe-Mir-36-P10  Egr-Mir-36-o36  Egr-Mir-36-o37  Esc-Mir-36-P14  Esc-Mir-36-P15  Gsa-Mir-36-o38  Gsa-Mir-36-o39  Gsp-Mir-36  Isc-Mir-36  Lhy-Mir-36  Llo-Mir-36  Lpo-Mir-36-P11  Lpo-Mir-36-P12  Lpo-Mir-36-P13  Mgi-Mir-36  Mom-Mir-36  Npo-Mir-36  Obi-Mir-36-P14  Obi-Mir-36-P15  Ofu-Mir-36  Ovu-Mir-36-P14  Ovu-Mir-36-P15  Pca-Mir-36-P23  Pca-Mir-36-P24  Pca-Mir-36-P25  Pcr-Mir-36  Pdu-Mir-36  Pve-Mir-36  Rph-Mir-36  Sma-Mir-36-o33  Sma-Mir-36-o34  Sma-Mir-36-o35  Sme-Mir-36-P19  Sme-Mir-36-P20a  Sme-Mir-36-P20b  Sne-Mir-36-P21  Sne-Mir-36-P22  Snu-Mir-36  Tca-Mir-36  Tur-Mir-36-P30  Tur-Mir-36-P31  Tur-Mir-36-P32  Tur-Mir-36-P33  Tur-Mir-36-P34  Tur-Mir-36-P35  Tur-Mir-36-P36  War-Mir-36 
Node of Origin (locus) Protostomia
Node of Origin (family) Protostomia
Genome context
(Phoronis_australis_GCA_002633005)		 NMRA01000011.1: 340936-340993 [-] Ensembl
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
CAAGAAAAGUCGAUGUGUCUAUCGUGGCCGGAUGAACGUUCGCCCUGGUGAUGUGUUUUGAAAUCAUCACCGGGUAAACAUUCAUCCAUUCUCGUAGACCUUUCAGCGAUCUACAAUG
Get precursor sequence
Structure
        10           20        30        40        50         
CAAGAAAAGUCGAUGUG---|   U  U  CC       C   CG   U       UGUUU 
                    UCUA CG GG  GGAUGAA GUU  CCC GGUGAUG     \
                    AGAU GC CU  CCUACUU CAA  GGG CCACUAC     U
GUAACAUCUAGCGACUUUCC^   -  U  UA       A   AU   -       UAAAG 
      110       100         90        80         70        60
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsCNNC at 3p(+17), UGUG in loop
Tissue expression
-   +
To
Star sequence

Pau-Mir-36_5p* (predicted)
mirBase accessionNone
Sequence 
0- GAUGAACGUUCGCCCUGGUGAUG -23
Get sequence
Mature sequence

Pau-Mir-36_3p
mirBase accessionNone
Sequence 
36- UCACCGGGUAAACAUUCAUCCA -58
Get sequence