MirGeneDB 3.0
88 Tetranychus urticae microRNA genes
Sort by genome coordinates Motifs Tissue expression
-   +
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC Ad Ad Ad Ad Ad Em To
Tur-Bantam None BANTAM GAGAUCA None None HE587306.1 2889816 2889879 - Protostomia Protostomia No 1
Tur-Let-7 None LET-7 GAGGUAG None None HE587316.1 480736 480809 + Bilateria Bilateria Unknown 1
Tur-Mir-1 tur-mir-1 MIR-1 GGAAUGU MIMAT0023094 MIMAT0023095 HE587326.1 697265 697325 + Bilateria Bilateria No 1
Tur-Mir-2-o142a tur-mir-2-1 MIR-2 AUCACAG MIMAT0023042 MIMAT0023043 HE587310.1 2525606 2525669 + T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-2-o142b tur-mir-2-2 MIR-2 AUCACAG MIMAT0023042 MIMAT0023043 HE587310.1 2523054 2523117 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-2-o143 None MIR-2 AUCACAG None None HE587302.1 3261040 3261110 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-7-P28 tur-mir-7 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0023036 MIMAT0023037 HE587302.1 1216514 1216576 - T. urticae Bilateria No 1
Tur-Mir-7-P29 None MIR-7 GGAAGAC None None HE587312.1 2160396 2160460 - T. urticae Bilateria Unknown 1 1
Tur-Mir-8 None MIR-8 AAUACUG None None HE587312.1 342369 342432 + Nephrozoa Nephrozoa No
Tur-Mir-9-P39a tur-mir-9-1 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0023082 MIMAT0023083 HE587301.1 1879586 1879648 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tur-Mir-9-P39b tur-mir-9-2 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0023082 MIMAT0023083 HE587301.1 1878278 1878340 - Bilateria Bilateria No 1 1
Tur-Mir-10-P1y None MIR-10 CUCUGUA None None HE587311.1 780226 780287 - T. urticae Eumetazoa No 1
Tur-Mir-10-P1z-v1 tur-mir-10 MIR-10 CCCUGUA MIMAT0023026 MIMAT0023027 HE587320.1 1111621 1111681 + T. urticae Eumetazoa No
Tur-Mir-10-P1z-v2 tur-mir-10 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023026 MIMAT0023027 HE587320.1 1111620 1111682 + T. urticae Eumetazoa No 1
Tur-Mir-10-P2 None MIR-10 ACCCGUA None None HE587316.1 479982 480084 + Bilateria Eumetazoa No 1
Tur-Mir-10-P4u tur-mir-993b MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023052 MIMAT0023053 HE587311.1 2466151 2466214 - T. urticae Eumetazoa No
Tur-Mir-10-P4v tur-mir-993a-2 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023058 MIMAT0023059 HE587311.1 2465365 2465427 - T. urticae Eumetazoa No 1
Tur-Mir-10-P4w tur-mir-993a-1 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0023058 MIMAT0023059 HE587311.1 2464812 2464873 - T. urticae Eumetazoa No
Tur-Mir-12-P14 tur-mir-12a MIR-12 GAGUAUU MIMAT0023102 MIMAT0023103 HE587328.1 1008240 1008300 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-12-P15 tur-mir-12b MIR-12 GAGUAUU MIMAT0023044 MIMAT0023045 HE587311.1 1901159 1901218 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-22-P2 tur-mir-745 MIR-22 AGCUGCC MIMAT0023048 MIMAT0023049 HE587308.1 2281016 2281101 + Bilateria Bilateria No
Tur-Mir-29-P1 None MIR-29 AGCACCA None None HE587328.1 416806 416867 - Bilateria Bilateria No 1
Tur-Mir-34 tur-mir-34 MIR-34 GGCAGUG MIMAT0023096 MIMAT0023097 HE587302.1 4478347 4478406 + Bilateria Bilateria No 1
Tur-Mir-36-P30 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096172 1096231 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P31 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096273 1096332 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P32 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096476 1096535 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P33 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096578 1096637 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P34 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096882 1096941 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P35 None MIR-36 GGUGGCU None None HE587309.1 1096984 1097043 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-36-P36 None MIR-36 CACCGGG None None HE587309.1 1097086 1097144 + T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-67 tur-mir-307 MIR-67 CACAACC MIMAT0023068 MIMAT0023069 HE587317.1 880795 880871 - Protostomia Protostomia No 1 1
Tur-Mir-71-P6a tur-mir-71-1 MIR-71 CUCACUA MIMAT0023040 MIMAT0023041 HE587310.1 2524818 2524890 + T. urticae Nephrozoa No 1
Tur-Mir-71-P6b tur-mir-71-2 MIR-71 CUCACUA MIMAT0023040 MIMAT0023041 HE587310.1 2523836 2523908 - T. urticae Nephrozoa No 1
Tur-Mir-76 None MIR-76 UCGUUGU None None gb|CM077717.1|:17556145-17556464 80 232 + Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tur-Mir-87-o38 None MIR-87 UGAGCAA None None HE587301.1 4415425 4415497 - T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-87-o39 tur-mir-87 MIR-87 AGCCGGA MIMAT0023066 MIMAT0023067 HE587301.1 4415225 4415289 - T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-87-o40 None MIR-87 UGAGCAA None None HE587301.1 4415090 4415158 - T. urticae Protostomia No 1
Tur-Mir-87-o41 None MIR-87 UGAGCAA None None HE587301.1 4414906 4414965 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-92-P21 None MIR-92 AUUGCAC None None HE587307.1 1360151 1360224 + T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-92-P22 None MIR-92 AUUGCAC None None HE587304.1 3805132 3805205 - T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-92-P23 tur-mir-92 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0023086 MIMAT0023087 HE587317.1 1593042 1593106 + T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-96-P2 tur-mir-263b MIR-96 UUGGCAC MIMAT0023108 MIMAT0023109 HE587335.1 152007 152070 - Bilateria Bilateria No
Tur-Mir-96-P3 tur-mir-263a MIR-96 AUGGCAC MIMAT0023112 MIMAT0023113 HE587335.1 152638 152699 - Bilateria Bilateria No 1
Tur-Mir-124-P46 tur-mir-124-1 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0023088 MIMAT0023089 HE587309.1 2159035 2159097 + T. urticae Bilateria No
Tur-Mir-124-P47 tur-mir-124-2 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0026457 MIMAT0023089 HE587309.1 2159846 2159908 + T. urticae Bilateria No 1
Tur-Mir-133 tur-mir-133 MIR-133 UGGUCCC MIMAT0023080 MIMAT0023081 HE587302.1 2687363 2687442 + Bilateria Bilateria No 1
Tur-Mir-137 tur-mir-137 MIR-137 GUAUUCC MIMAT0023098 MIMAT0023099 HE587323.1 1210039 1210104 + Bilateria Bilateria No 1 1
Tur-Mir-153 None MIR-153 UGCAUAG None None HE587303.1 4160352 4160418 + Bilateria Bilateria No 1
Tur-Mir-184 tur-mir-184 MIR-184 GGACGGA MIMAT0023072 MIMAT0023073 HE587310.1 1724590 1724655 - Nephrozoa Nephrozoa No 1
Tur-Mir-190 tur-mir-190 MIR-190 GAUAUGU MIMAT0023084 MIMAT0023085 HE587310.1 790352 790416 + Bilateria Bilateria No
Tur-Mir-210-P21 None MIR-210 UGUGCGU None None HE587323.1 68257 68325 + T. urticae Bilateria No 1 1
Tur-Mir-210-P22 None MIR-210 UGUGCGU None None HE587323.1 74280 74348 - T. urticae Bilateria No 1 1
Tur-Mir-216-P2 tur-mir-5737 MIR-216 AAUCUCA MIMAT0023104 MIMAT0023105 HE587311.1 1901303 1901367 - Nephrozoa Nephrozoa Unknown 1
Tur-Mir-219 None MIR-219 GAUUGUC None None HE587305.1 3464891 3464953 - Bilateria Bilateria No
Tur-Mir-252-P1 None MIR-252 UAAGUAG None None HE587309.1 1327878 1328002 + Bilateria Bilateria No
Tur-Mir-252-P2-v1 tur-mir-252 MIR-252 UAAGUAC MIMAT0023076 MIMAT0023077 HE587307.1 717896 717972 - Bilateria Bilateria Unknown 1
Tur-Mir-252-P2-v2 tur-mir-252 MIR-252 AAGUACU MIMAT0023076 MIMAT0023077 HE587307.1 717897 717971 - Bilateria Bilateria Unknown
Tur-Mir-276 tur-mir-276 MIR-276 AGGAACU MIMAT0023034 MIMAT0023035 HE587306.1 1311432 1311494 + Arthropoda Arthropoda No 1 1
Tur-Mir-277 None MIR-277 AAAUGCA None None HE587302.1 4477146 4477214 + Protostomia Protostomia No
Tur-Mir-278 tur-mir-278 MIR-278 CGGUGGG MIMAT0023030 MIMAT0023031 HE587301.1 5514204 5514268 + Bilateria Bilateria No
Tur-Mir-279-P26 None MIR-279 GACUAGA None None HE587309.1 1091933 1091994 + T. urticae Protostomia No 1 1 1
Tur-Mir-279-P27a tur-mir-279 MIR-279 GACUAGA MIMAT0023106 MIMAT0023107 HE587308.1 2468600 2468662 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-279-P27b tur-mir-279 MIR-279 GACUAGA MIMAT0023106 MIMAT0023107 HE587308.1 2463767 2463829 - T. urticae Protostomia No
Tur-Mir-281 tur-mir-281 MIR-281 AGAGAGC MIMAT0023046 MIMAT0023047 HE587305.1 3874609 3874669 + Nephrozoa Nephrozoa No 1 1
Tur-Mir-305 tur-mir-305 MIR-305 UUGUACU MIMAT0023114 MIMAT0023115 HE587305.1 3433624 3433695 + Cryptovermes Cryptovermes No 1
Tur-Mir-315 None MIR-315 UUUGAUU None None HE587327.1 742314 742406 - Nephrozoa Nephrozoa No
Tur-Mir-317 tur-mir-317 MIR-317 GAACACA MIMAT0023060 MIMAT0023061 HE587302.1 4474819 4474887 + Protostomia Protostomia No 1
Tur-Mir-375 None MIR-375 UUGUUCG None None HE587325.1 499265 499498 - Nephrozoa Nephrozoa No
Tur-Mir-750 None MIR-750 CAGAUCU None None HE587319.1 654152 654217 - Protostomia Protostomia No
Tur-Mir-1175-v1 None MIR-1175 GAGAUUC None None HE587319.1 654009 654071 - Protostomia Protostomia No 1
Tur-Mir-1175-v2 None MIR-1175 GGAGAAG None None HE587319.1 654012 654068 - Protostomia Protostomia No
Tur-Mir-1993 None MIR-1993 AUUAUGC None None HE587302.1 2071519 2071583 + Protostomia Protostomia No
Tur-Mir-2001 None MIR-2001 UGUGACC None None HE587309.1 1324887 1324960 + Bilateria Bilateria No 1
Tur-Mir-3931 tur-mir-3931 MIR-3931 ACUUUGA MIMAT0023090 MIMAT0023091 HE587302.1 3048006 3048067 - Chelicerata Chelicerata No 1
Tur-Mir-5731-P1a tur-mir-5731 MIR-5731 UGGGCAC MIMAT0023056 MIMAT0023057 HE587494.1 1952 2039 - T. urticae T. urticae No 1 1
Tur-Mir-5731-P1b tur-mir-5731 MIR-5731 UGGGCAC MIMAT0023056 MIMAT0023057 HE587494.1 6201 6288 - T. urticae T. urticae No 1 1
Tur-Mir-5731-P1c tur-mir-5731 MIR-5731 UGGGCAC MIMAT0023056 MIMAT0023057 HE587301.1 1420763 1420850 - T. urticae T. urticae No 1 1
Tur-Mir-5733 tur-mir-5733 MIR-5733 ACUUGAU MIMAT0023064 MIMAT0023065 HE587301.1 1416967 1417036 - T. urticae T. urticae No 1
Tur-Mir-5734 tur-mir-5734 MIR-5734 UGGGGUA MIMAT0023074 MIMAT0023075 HE587301.1 1423018 1423077 - T. urticae T. urticae No
Tur-Mir-5735 tur-mir-5735 MIR-5735 GGACAAC MIMAT0023092 MIMAT0023093 HE587314.1 1981826 1981884 + Chelicerata Chelicerata No 1
Tur-Mir-5736-v1 tur-mir-5736a MIR-5736 UUCGCCA MIMAT0023100 MIMAT0023101 HE587301.1 1424674 1424736 - T. urticae T. urticae No
Tur-Mir-5736-v2 tur-mir-5736a MIR-5736 UGCGGAG MIMAT0023100 MIMAT0023101 HE587301.1 1424673 1424737 - T. urticae T. urticae No
Tur-Mir-5738 tur-mir-5738 MIR-5738 AUGUAAU MIMAT0023110 MIMAT0023111 HE587302.1 4314298 4314360 - T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-1 None TUR-NOVEL-1 CGGAUUG None None HE587302.1 6079671 6079731 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-2 None TUR-NOVEL-2 UCACAAC None None HE587314.1 2074896 2074957 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-3 None TUR-NOVEL-3 AUAAAAU None None HE587303.1 2777364 2777427 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-4 None TUR-NOVEL-4 AGGAAAG None None HE587327.1 533052 533118 + T. urticae T. urticae No
Tur-Novel-5 None TUR-NOVEL-5 ACCGGGA None None HE587309.1 1096052 1096111 + T. urticae T. urticae No 1 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all

Download genome coordinates (GFF format)

Download count matrix