MirGeneDB 3.0
418 Danio rerio microRNA genes
Sort by genome coordinates Motifs Tissue expression
-   +
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC Br Br Em Ey Gu Gu He Li Li Ov Te
Dre-Let-7-P1b1 dre-let-7d-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001762 MIMAT0031931 chr16 24881136 24881205 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Let-7-P1b2 dre-let-7d-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001762 MIMAT0031931 chr19 9429867 9429936 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Let-7-P1c1 dre-let-7c-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001761 MIMAT0031930 chr15 29795845 29795911 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1c2 dre-let-7c-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001761 MIMAT0031930 chr10 38072088 38072154 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1d1 dre-let-7a-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr15 21437886 21437952 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1d2 dre-let-7a-4 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr5 29990466 29990532 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P2a1a dre-let-7a-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr11 27503240 27503310 - Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2a2a dre-let-7a-3 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr4 18654173 18654244 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P2a2b None LET-7 GAGGUAG None None chr25 2189978 2190049 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Let-7-P2a3a dre-let-7g-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001765 None chr23 28536374 28536444 + Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2a3b dre-let-7g-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001765 None chr23 18382469 18382538 - Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2a4a dre-let-7e LET-7 GAGGUAG None None chr23 5431431 5431503 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2a4b None LET-7 GAGGUAG None None chr6 54507105 54507176 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b1a dre-let-7f LET-7 GAGGUAG MIMAT0001764 None chr11 27503037 27503113 - Clupeocephala Bilateria Yes
Dre-Let-7-P2b2a dre-let-7b LET-7 GAGGUAG MIMAT0001760 None chr4 18653156 18653231 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b2b None LET-7 GAGGUAG None None chr25 2192692 2192767 + Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b3a dre-let-7h LET-7 GAGGUAG MIMAT0001766 None chr23 28536683 28536763 + Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b4a dre-let-7a-5 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr23 5431216 5431292 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b4b dre-let-7a-6 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr6 54506483 54506558 - Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2c2b dre-let-7i LET-7 GAGGUAG MIMAT0001767 None chr25 1629663 1629739 - Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2c3 dre-let-7j LET-7 GAGGUAG MIMAT0003015 None chr6 41454794 41454872 + Gnathostomata Bilateria Yes 1 1
Dre-Mir-1-P1 dre-mir-1-2 MIR-1 GGAAUGU None MIMAT0001768 chr2 4116326 4116387 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-1-P2a dre-mir-206-1 MIR-1 GGAAUGU MIMAT0031988 MIMAT0001866 chr20 19544667 19544726 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-1-P2b dre-mir-206-2 MIR-1 GGAAUGU None MIMAT0001866 chr17 5967262 5967321 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-1-P3 dre-mir-1-1 MIR-1 GGAAUGU None MIMAT0001768 chr23 7210180 7210240 - Gnathostomata Bilateria No
Dre-Mir-7-P1a dre-mir-7a-1 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr25 12472469 12472532 + Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-7-P1b dre-mir-7a-2 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr7 14450544 14450608 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-7-P2b dre-mir-7b MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001265 None chr5 55607762 55607825 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-7-P3 None MIR-7 GGAAGAC None None chr16 45902460 45902524 + Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-7-P4b dre-mir-7a-3 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr8 10232 10295 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-8-P1a dre-mir-200b MIR-8 AAUACUG MIMAT0031985 MIMAT0001862 chr23 24072041 24072100 + Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-8-P1b dre-mir-200c MIR-8 AAUACUG MIMAT0031986 MIMAT0001863 chr6 40656216 40656274 - Vertebrata Nephrozoa No 1 1 1
Dre-Mir-8-P2a dre-mir-200a MIR-8 AACACUG MIMAT0031984 MIMAT0001861 chr23 24072173 24072233 + Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-8-P2b dre-mir-141 MIR-8 AACACUG MIMAT0031974 MIMAT0001837 chr6 40656013 40656073 - Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-8-P3a dre-mir-429a MIR-8 AAUACUG None MIMAT0001624 chr23 24073828 24073886 + Vertebrata Nephrozoa No 1 1
Dre-Mir-8-P3b dre-mir-429b MIR-8 AAUACUG None MIMAT0011291 chr6 40653151 40653208 - Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-9-P1a dre-mir-9-3 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr25 8551263 8551322 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-9-P1b dre-mir-9-6 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr7 14379556 14379617 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P2a dre-mir-9-2 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr10 43535995 43536054 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P2b dre-mir-9-5 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr5 48170110 48170169 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-9-P3a dre-mir-9-1 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr16 29216288 29216349 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P4a dre-mir-9-4 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0031932 chr22 18254783 18254842 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P4b dre-mir-9-7 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0031933 chr2 59102181 59102239 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-10-P1b1-v1 dre-mir-10b-1 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001268 MIMAT0031919 chr9 1952963 1953024 - Clupeocephala Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P1b1-v2 dre-mir-10b-1 MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001268 MIMAT0031919 chr9 1952964 1953023 - Clupeocephala Eumetazoa No
Dre-Mir-10-P1b2-v1 dre-mir-10d MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001771 MIMAT0003394 chr6 10867051 10867112 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1b2-v2 dre-mir-10d MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001771 MIMAT0003394 chr6 10867052 10867111 + Clupeocephala Eumetazoa No
Dre-Mir-10-P1c1-v1 dre-mir-10c MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001770 MIMAT0031935 chr3 23720666 23720728 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1c1-v2 dre-mir-10c MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001770 MIMAT0031935 chr3 23720667 23720727 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1c2-v1 dre-mir-10a MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001267 MIMAT0003391 chr12 27134886 27134944 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P1c2-v2 dre-mir-10a MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001267 MIMAT0003391 chr12 27134887 27134943 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1d1-v1 dre-mir-10b-2 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001268 MIMAT0031934 chr23 36130016 36130078 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1d1-v2 dre-mir-10b-2 MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001268 MIMAT0031934 chr23 36130017 36130077 + Clupeocephala Eumetazoa Unknown
Dre-Mir-10-P2c1 dre-mir-99-1 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001812 None chr15 29795596 29795654 + Clupeocephala Eumetazoa Yes
Dre-Mir-10-P2c2 dre-mir-99-2 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001812 None chr10 38074322 38074380 - Clupeocephala Eumetazoa Yes 1
Dre-Mir-10-P2d1 dre-mir-100-1 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001813 MIMAT0031957 chr15 21437656 21437712 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1 1
Dre-Mir-10-P2d2 dre-mir-100-2 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001813 MIMAT0031958 chr5 29990157 29990213 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1 1
Dre-Mir-10-P3b1 dre-mir-125a-1 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001820 None chr16 24898184 24898242 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3b2 dre-mir-125a-2 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001820 None chr19 9443800 9443858 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3c1 dre-mir-125c MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001822 MIMAT0031966 chr15 29800981 29801041 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P3c2 dre-mir-125b-3 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031965 chr10 38051674 38051736 - Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3d1 dre-mir-125b-1 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031963 chr15 21447701 21447762 + Clupeocephala Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P3d2 dre-mir-125b-2 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031964 chr5 29998775 29998836 + Clupeocephala Eumetazoa No 1
Dre-Mir-15-P1a1 dre-mir-15a-1 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001772 MIMAT0003395 chr1 46722633 46722692 - Clupeocephala Olfactores No
Dre-Mir-15-P1a2 dre-mir-15a-2 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001772 None chr9 29652531 29652588 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P1b dre-mir-15c MIR-15 AGCAGCG MIMAT0003764 None chr15 1543699 1543757 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P1d dre-mir-15b MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001773 MIMAT0031936 chr7 26070912 26070973 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2a1 dre-mir-16b MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001775 None chr1 46722416 46722480 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2a2 dre-mir-16c MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001776 MIMAT0031937 chr9 29652389 29652453 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2b dre-mir-16a MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001774 None chr15 1543869 1543933 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2c-v1 dre-mir-457b MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001884 MIMAT0032004 chr14 31521938 31521997 - Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2c-v2 dre-mir-457b MIR-15 CCAGUAU MIMAT0001884 MIMAT0032004 chr14 31521939 31521996 - Gnathostomata Olfactores No
Dre-Mir-15-P2d dre-mir-457a MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001883 None chr7 26071436 26071500 + Gnathostomata Olfactores No 1
Dre-Mir-17-P1a1 dre-mir-17a-1 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001777 MIMAT0003396 chr1 3298149 3298209 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P1a2 dre-mir-17a-2 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001777 MIMAT0031938 chr9 53436955 53437013 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P2a1 dre-mir-18a MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001779 None chr1 3298014 3298078 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-17-P2a2 dre-mir-18b MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001780 MIMAT0003397 chr9 53436841 53436905 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-17-P2c dre-mir-18c MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001781 None chr14 31467386 31467450 - Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P4a1 dre-mir-20a MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001786 MIMAT0003400 chr1 3297646 3297705 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P4a2 None MIR-17 AAAGUGC None None chr9 53436542 53436606 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P4c dre-mir-20b MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001778 MIMAT0031939 chr14 31467183 31467241 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-17-P4d dre-mir-93 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001810 None chr14 100511 100568 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P1a1 dre-mir-19a MIR-19 GUGCAAA MIMAT0003398 MIMAT0001782 chr1 3297862 3297919 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P1a2 None MIR-19 GUGCAAA None None chr9 53436701 53436758 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-19-P2a1 dre-mir-19b MIR-19 GUGCAAA MIMAT0003399 MIMAT0001783 chr1 3297494 3297555 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-19-P2a2 None MIR-19 GUGCAAA None None chr9 53436416 53436475 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-19-P2c dre-mir-19c MIR-19 GUGCAAA MIMAT0031940 MIMAT0001784 chr14 31467045 31467105 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P2d dre-mir-19d MIR-19 GUGCAAA MIMAT0031941 MIMAT0001785 chr14 100674 100734 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-21-P1 dre-mir-21-1 MIR-21 AGCUUAU MIMAT0001787 None chr10 28198933 28198993 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-21-P2 dre-mir-21-2 MIR-21 AGCUUAU MIMAT0001787 None chr15 17373822 17373880 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-22-P1a dre-mir-22b MIR-22 AGCUGCC MIMAT0031943 MIMAT0001789 chr5 12610815 12610873 + Vertebrata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-22-P1b1 dre-mir-22a MIR-22 AGCUGCC MIMAT0031942 MIMAT0001788 chr15 24908404 24908466 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-22-P1b2 None MIR-22 AGCUGCC None None chr21 39267231 39267293 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-23-P1 dre-mir-23a-3 MIR-23 UCACAUU MIMAT0031945 MIMAT0001790 chr2 33900445 33900503 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-23-P2a dre-mir-23b MIR-23 UCACAUU None MIMAT0001791 chr10 15954588 15954651 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-23-P2b dre-mir-23b-2 MIR-23 UCACAUU MIMAT0048660 MIMAT0048661 chr8 30167636 30167695 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-23-P3 dre-mir-23a-2 MIR-23 UCACAUU MIMAT0031944 MIMAT0001790 chr3 13406243 13406303 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-23-P4a dre-mir-23a-1 MIR-23 UCACAUU None MIMAT0001790 chr22 5293226 5293289 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-24-P1 dre-mir-24b MIR-24 GGCUCAG MIMAT0048662 MIMAT0048663 chr2 33905775 33905834 + Gnathostomata Vertebrata Yes
Dre-Mir-24-P2a dre-mir-24-1 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr10 15960847 15960904 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-24-P2b dre-mir-24-3 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr8 30162533 30162590 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-24-P3 dre-mir-24-2 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr3 13412992 13413050 + Gnathostomata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-24-P4a dre-mir-24-4 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr22 5307502 5307561 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-26-P1a dre-mir-26a-3 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 None chr24 20470992 20471052 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-26-P1b dre-mir-26a-2 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 MIMAT0031948 chr2 21375503 21375560 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-26-P2a dre-mir-26a-1 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 MIMAT0031947 chr9 41733543 41733602 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-26-P4 dre-mir-26b MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001795 None chr23 24675224 24675284 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-27-P1 dre-mir-27a MIR-27 UCACAGU MIMAT0031949 MIMAT0001796 chr2 33902361 33902423 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-27-P2a dre-mir-27d MIR-27 UCACAGU None MIMAT0001799 chr10 15954740 15954804 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-27-P2b dre-mir-27b MIR-27 UCACAGU MIMAT0031950 MIMAT0001797 chr8 30167449 30167508 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-27-P3 dre-mir-27c MIR-27 UCACAGU MIMAT0003401 MIMAT0001798 chr3 13406464 13406527 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-27-P4a dre-mir-27e MIR-27 UCACAGU None MIMAT0001800 chr22 5299972 5300035 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-29-P1b1 dre-mir-29b-2 MIR-29 AGCACCA None MIMAT0001801 chr4 11608208 11608269 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-29-P1d1 dre-mir-29b-1 MIR-29 CUGAAUU None MIMAT0001801 chr6 47467922 47467983 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-29-P1d2 dre-mir-29b3 MIR-29 AGCACCA MIMAT0048667 MIMAT0048668 chr23 32440125 32440189 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-29-P2b1 dre-mir-29a MIR-29 AGCACCA None MIMAT0001802 chr4 11606782 11606841 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-29-P2d2 None MIR-29 AGCACCA None None chr23 32439975 32440034 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-30-P1a dre-mir-30d MIR-30 GUAAACA MIMAT0001806 None chr16 25341450 25341514 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1 1
Dre-Mir-30-P1b dre-mir-30e-2 MIR-30 GUAAACA MIMAT0001807 MIMAT0003402 chr13 27795140 27795201 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-30-P1d None MIR-30 GUAAACA None None chr19 42099800 42099865 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-30-P1o1 dre-mir-30a MIR-30 GUAAACA MIMAT0001803 MIMAT0031951 chr19 4737589 4737653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-30-P2a dre-mir-30b MIR-30 GUAAACA MIMAT0001804 None chr16 25341739 25341799 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-30-P2b dre-mir-30c MIR-30 GUAAACA MIMAT0001805 MIMAT0031952 chr13 27804077 27804137 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-30-P2d None MIR-30 GUAAACA None None chr19 42101719 42101778 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-31 dre-mir-31 MIR-31 GGCAAGA MIMAT0003347 None chr7 73263755 73263815 - Bilateria Bilateria No 1
Dre-Mir-33-P1a None MIR-33 AAUGUUC None None LKPD01061375.1 1389 1445 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-34-P1 dre-mir-34a MIR-34 GGCAGUG MIMAT0001269 None chr23 22591076 22591140 + Gnathostomata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-34-P2a dre-mir-34b MIR-34 GGCAGUG MIMAT0003346 None chr5 57922533 57922591 - Vertebrata Bilateria No 1
Dre-Mir-34-P2b dre-mir-34c MIR-34 GGCAGUG MIMAT0003759 MIMAT0032011 chr5 57922296 57922352 - Vertebrata Bilateria No
Dre-Mir-92-P1a1 dre-mir-92a-1 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031953 MIMAT0001808 chr1 3297377 3297435 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-92-P1a2 dre-mir-92a-2 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031954 MIMAT0001808 chr9 53436299 53436355 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-92-P1d dre-mir-92b MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031955 MIMAT0001809 chr16 42898443 42898505 + Gnathostomata Bilateria No
Dre-Mir-92-P2c dre-mir-363 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031992 MIMAT0001874 chr14 31466699 31466769 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-92-P2d dre-mir-25 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031946 MIMAT0001793 chr14 100779 100838 + Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-96-P1a dre-mir-96 MIR-96 UUGGCAC MIMAT0001811 MIMAT0031956 chr4 15074738 15074801 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-96-P2a dre-mir-182 MIR-96 UUGGCAA MIMAT0001271 MIMAT0001272 chr4 15075668 15075732 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-96-P3a-v1 dre-mir-183 MIR-96 AUGGCAC MIMAT0001273 MIMAT0031921 chr4 15074581 15074642 + Clupeocephala Bilateria Yes 1 1
Dre-Mir-96-P3a-v2 dre-mir-183 MIR-96 UGGCACU MIMAT0001273 MIMAT0031921 chr4 15074582 15074641 + Clupeocephala Bilateria Yes 1
Dre-Mir-101-P1-v1 dre-mir-101a MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0001814 chr6 31365458 31365516 + Vertebrata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-101-P1-v2 dre-mir-101a MIR-101 UACAGUA None MIMAT0001814 chr6 31365459 31365515 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-101-P2-v1 dre-mir-101b MIR-101 ACAGUAC None MIMAT0001815 chr5 1837176 1837234 - Vertebrata Vertebrata No 1 1 1
Dre-Mir-101-P2-v2 dre-mir-101b MIR-101 UACAGUA None MIMAT0001815 chr5 1837177 1837233 - Vertebrata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-103-P1a dre-mir-107b MIR-103 GCAGCAU None MIMAT0011301 chr17 23573143 23573202 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-103-P1b dre-mir-107a MIR-103 GCAGCAU MIMAT0031959 MIMAT0001817 chr12 16960706 16960765 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-103-P2a dre-mir-103 MIR-103 GCAGCAU None MIMAT0001816 chr13 15223311 15223370 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-103-P2b None MIR-103 GCAGCAU None None chr14 44827467 44827526 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-122 dre-mir-122 MIR-122 GGAGUGU MIMAT0001818 None chr21 10881430 10881488 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-124-P1a-v1 dre-mir-124-1 MIR-124 AAGGCAC None MIMAT0001819 chr2 26645327 26645385 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P1a-v2 dre-mir-124-1 MIR-124 UAAGGCA None MIMAT0001819 chr2 26645328 26645385 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-124-P1b-v1 dre-mir-124-3 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr24 24455662 24455720 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P1b-v2 dre-mir-124-3 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr24 24455662 24455719 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P2a-v1 dre-mir-124-2 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr20 38905541 38905601 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P2a-v2 dre-mir-124-2 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr20 38905542 38905601 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3a-v1 dre-mir-124-5 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr23 17783451 17783510 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3a-v2 dre-mir-124-5 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr23 17783451 17783509 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3b-v1 dre-mir-124-6 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031962 MIMAT0001819 chr8 23122788 23122847 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3b-v2 dre-mir-124-6 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031962 MIMAT0001819 chr8 23122789 23122847 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P4-v1 dre-mir-124-4 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031961 MIMAT0001819 chr17 27402274 27402333 + Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P4-v2 dre-mir-124-4 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031961 MIMAT0001819 chr17 27402274 27402332 + Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-126-P2a-v1 dre-mir-126a MIR-126 CGUACCG MIMAT0003157 MIMAT0001823 chr8 11548435 11548494 - Clupeocephala Olfactores No
Dre-Mir-126-P2a-v2 dre-mir-126a MIR-126 AUUAUUA MIMAT0003157 MIMAT0001823 chr8 11548435 11548494 - Clupeocephala Olfactores No
Dre-Mir-126-P2a-v3 dre-mir-126a MIR-126 UCGUACC MIMAT0003157 MIMAT0001823 chr8 11548435 11548494 - Clupeocephala Olfactores No
Dre-Mir-126-P2b-v1 dre-mir-126b MIR-126 CGUACCG MIMAT0011307 MIMAT0011306 chr21 7240249 7240307 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-126-P2b-v2 dre-mir-126b MIR-126 AUUAUUA MIMAT0011307 MIMAT0011306 chr21 7240249 7240307 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-126-P2b-v3 dre-mir-126b MIR-126 UCGUACC MIMAT0011307 MIMAT0011306 chr21 7240249 7240307 - Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-128-P1 dre-mir-128-2 MIR-128 CACAGUG None MIMAT0001824 chr19 42915449 42915507 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-128-P2a dre-mir-128-1 MIR-128 CACAGUG MIMAT0031967 MIMAT0001824 chr22 12374807 12374865 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-128-P2b dre-mir-128-3 MIR-128 CACAGUG MIMAT0048666 MIMAT0001824 chrUn_KN150366v1 5637 5693 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-129-P1a dre-mir-129-4 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0003158 chr25 30176484 30176548 + Clupeocephala Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-129-P1b dre-mir-129-2 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0003158 chr7 50287944 50288006 - Clupeocephala Chordata No 1 1
Dre-Mir-129-P2a dre-mir-129-3 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0048649 chr18 10670670 10670735 + Clupeocephala Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-129-P2b dre-mir-129-1 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0031968 chr4 19047477 19047542 - Clupeocephala Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-130-P1a1 dre-mir-130c-2 MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031969 MIMAT0001828 chr5 13288840 13288898 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P1a2 dre-mir-130c-1 MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031969 MIMAT0001828 chr10 17453405 17453463 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-130-P1b1 dre-mir-130a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001826 chr10 33377140 33377202 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-130-P2a1 dre-mir-301b MIR-130 CUUUGAC MIMAT0031990 MIMAT0001871 chr5 13289363 13289425 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P2a2 dre-mir-301c MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031991 MIMAT0001872 chr10 17454501 17454563 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P2b1 dre-mir-301a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001870 chr10 33377012 33377073 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P3a1 dre-mir-454b MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001878 chr5 13296331 13296395 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P3b1 dre-mir-454a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001877 chr10 33376841 33376905 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P4a1 dre-mir-130b MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001827 chr5 13299343 13299404 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P1a dre-mir-132-1 MIR-132 AACAGUC MIMAT0003403 MIMAT0001829 chr15 25897727 25897789 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P1b dre-mir-132-2 MIR-132 AACAGUC None MIMAT0001829 chr10 35645043 35645103 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P2a dre-mir-212 MIR-132 CCUUGGC None MIMAT0003049 chr15 25897460 25897528 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P2b dre-mir-212-2 MIR-132 CCUUGGC MIMAT0048650 MIMAT0048651 chr10 35644719 35644787 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-133-P1-v1 dre-mir-133a-1 MIR-133 UUGGUCC MIMAT0003404 MIMAT0001830 chr2 4114133 4114192 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-133-P1-v2 dre-mir-133a-1 MIR-133 UGGUCCC MIMAT0003404 MIMAT0001830 chr2 4114133 4114192 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-133-P2a-v1 dre-mir-133b MIR-133 UUGGUCC MIMAT0003405 MIMAT0001831 chr20 19543389 19543448 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-133-P2a-v2 dre-mir-133b MIR-133 UGGUCCC MIMAT0003405 MIMAT0001831 chr20 19543389 19543448 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-133-P2b-v1 dre-mir-133c MIR-133 UUGGUCC MIMAT0031971 MIMAT0001832 chr17 5962990 5963049 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-133-P2b-v2 dre-mir-133c MIR-133 UGGUCCC MIMAT0031971 MIMAT0001832 chr17 5962990 5963049 - Clupeocephala Bilateria No
Dre-Mir-133-P3-v1 dre-mir-133a-2 MIR-133 UUGGUCC MIMAT0031970 MIMAT0001830 chr23 7172131 7172190 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-133-P3-v2 dre-mir-133a-2 MIR-133 UGGUCCC MIMAT0031970 MIMAT0001830 chr23 7172131 7172190 - Gnathostomata Bilateria No 1
Dre-Mir-135-P1 dre-mir-135b MIR-135 AUGGCUU MIMAT0003032 MIMAT0032006 chr8 26005600 26005660 + Gnathostomata Chordata No 1 1
Dre-Mir-135-P2a dre-mir-135a MIR-135 AUGGCUU MIMAT0003348 None chr25 31044133 31044192 - Clupeocephala Chordata No 1
Dre-Mir-135-P4a dre-mir-135c-1 MIR-135 AUGGCUU MIMAT0001833 None chr11 38175079 38175140 - Clupeocephala Chordata No 1
Dre-Mir-135-P4b dre-mir-135c-2 MIR-135 AUGGCUU MIMAT0001833 None chr23 18063203 18063264 - Clupeocephala Chordata No 1
Dre-Mir-137-P1a-v1 dre-mir-137-2 MIR-137 UAUUGCU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145753 20145811 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-137-P1a-v2 dre-mir-137-2 MIR-137 AUUGCUU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145752 20145812 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-137-P1b-v1 dre-mir-137-1 MIR-137 UAUUGCU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145753 20145811 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-137-P1b-v2 dre-mir-137-1 MIR-137 AUUGCUU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145752 20145812 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-138-P1a dre-mir-138-2 MIR-138 GCUGGUG MIMAT0001835 MIMAT0048652 chr16 7836268 7836329 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-138-P2 dre-mir-138-1 MIR-138 GCUGGUG MIMAT0001835 MIMAT0031973 chr18 17580169 17580236 + Vertebrata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-139 dre-mir-139 MIR-139 CUACAGU MIMAT0003349 MIMAT0032008 LKPD01049450.1 531 590 - Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-140-P2-v1 dre-mir-140 MIR-140 CCACAGG MIMAT0001836 MIMAT0003159 chr25 34791384 34791445 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-140-P2-v2 dre-mir-140 MIR-140 ACCACAG MIMAT0001836 MIMAT0003159 chr25 34791384 34791445 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P2-v1 dre-mir-142a MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170753 3170812 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P2-v2 dre-mir-142a MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170753 3170812 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P2-v3 dre-mir-142a MIR-142 GUAGUGU MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170753 3170812 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P2-v4 dre-mir-142a MIR-142 CCAUAAA MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170751 3170814 + Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-142-P4-v1 dre-mir-142b MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001839 None chr15 15383910 15383969 - Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P4-v2 dre-mir-142b MIR-142 UAGUGUU MIMAT0001839 None chr15 15383910 15383969 - Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P4-v3 dre-mir-142b MIR-142 GUAGUGU MIMAT0001839 None chr15 15383910 15383969 - Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-143 dre-mir-143 MIR-143 GAGAUGA None MIMAT0001840 chr14 38742335 38742389 + Vertebrata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-144-v1 dre-mir-144 MIR-144 ACAGUAU MIMAT0031975 MIMAT0001841 chr5 42272092 42272150 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-144-v2 dre-mir-144 MIR-144 UACAGUA MIMAT0031975 MIMAT0001841 chr5 42272092 42272150 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-145 dre-mir-145 MIR-145 UCCAGUU MIMAT0001842 MIMAT0031976 chr14 38743970 38744030 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-146-P1 dre-mir-146a MIR-146 GAGAACU MIMAT0001843 None chr13 11822194 11822254 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1 1
Dre-Mir-146-P4-v1 dre-mir-146b MIR-146 GAGAACU MIMAT0001844 None chr21 41639990 41640048 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-146-P4-v2 dre-mir-146b MIR-146 UGAGAAC MIMAT0001844 None chr21 41639989 41640049 + Gnathostomata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-148-P2 dre-mir-148 MIR-148 CAGUGCA None MIMAT0001845 chr9 1644693 1644750 - Gnathostomata Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-148-P3 dre-mir-152 MIR-148 CAGUGCA None MIMAT0001847 chr3 24095972 24096030 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-150 dre-mir-150 MIR-150 CUCCCAA MIMAT0001846 None chr3 32571319 32571379 + Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-153-P1a dre-mir-153a MIR-153 UGCAUAG MIMAT0031978 MIMAT0001849 chr7 40485520 40485580 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-153-P2a dre-mir-153c MIR-153 UGCAUAG MIMAT0031979 MIMAT0001850 chr9 7612418 7612477 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-153-P2b dre-mir-153b MIR-153 UCAUUUU MIMAT0031977 MIMAT0001848 chr6 13980987 13981046 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-155 dre-mir-155 MIR-155 UAAUGCU MIMAT0001851 None chr1 576454 576513 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-181-P1a1 dre-mir-181a-1 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0001282 chr22 22826011 22826074 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P1a2 dre-mir-181a-4 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048653 chr21 8221816 8221875 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-181-P1b2 dre-mir-181a-2 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0032007 chr8 53023545 53023607 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P1c1 dre-mir-181a-5 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048655 chr2 45204644 45204703 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-181-P1c2 dre-mir-181a-3 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048654 chr3 34197460 34197519 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-181-P2a1 dre-mir-181b-3 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 MIMAT0048656 chr22 22825805 22825864 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-181-P2a2 dre-mir-181d MIR-181 ACAUUCA MIMAT0048657 MIMAT0048658 chr21 8221672 8221730 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P2b2 dre-mir-181b-2 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 MIMAT0031920 chr8 53023694 53023753 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-181-P2c1 dre-mir-181b-1 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 None chr2 45202237 45202295 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-181-P2c2 dre-mir-181c MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001852 MIMAT0031980 chr3 34197705 34197762 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-184-P1 dre-mir-184-1 MIR-184 GGACGGA None MIMAT0001853 chr18 26203314 26203376 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-184-P2 dre-mir-184-2 MIR-184 GGACGGA None MIMAT0001853 chr7 30189601 30189663 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-187 dre-mir-187 MIR-187 CGUGUCU None MIMAT0001274 chr19 34135627 34135688 + Osteichthyes Osteichthyes Yes 1
Dre-Mir-190-P1b dre-mir-190a MIR-190 GAUAUGU MIMAT0001854 None chr25 33139120 33139178 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-190-P3 dre-mir-190b MIR-190 GAUAUGU MIMAT0003747 None chr16 17705910 17705973 - Gnathostomata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-191 dre-mir-462 MIR-191 AACGGAA MIMAT0001855 None chr8 26082318 26082381 + Gnathostomata Gnathostomata No
Dre-Mir-192-P4b dre-mir-192 MIR-192 UGACCUA MIMAT0001275 None chr10 27063369 27063431 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-193-P1a dre-mir-193b MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031982 MIMAT0001857 chr3 43714712 43714771 + Vertebrata Bilateria No 1 1
Dre-Mir-193-P1b1 dre-mir-193a-1 MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031981 MIMAT0001856 chr3 35959932 35959993 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P1b2 dre-mir-193a-2 MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031981 MIMAT0001856 chr6 18517992 18518050 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P2a dre-mir-365-1 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr3 43716841 43716901 + Vertebrata Bilateria Yes 1
Dre-Mir-193-P2b1 dre-mir-365-2 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr3 35961005 35961067 + Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P2b2 dre-mir-365-3 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr6 18516330 18516392 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-194-P4a dre-mir-194b MIR-194 GUAACAG MIMAT0001859 None LKPD01021295.1 6148 6206 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-194-P4b dre-mir-194a MIR-194 GUAACAG MIMAT0001858 None chr10 27063188 27063244 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-196-P1a dre-mir-196a-2 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001276 MIMAT0031983 chr19 19747629 19747686 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P1b dre-mir-196d MIR-196 AGGUAGU MIMAT0011313 None chr16 20913420 20913478 + Clupeocephala Olfactores No
Dre-Mir-196-P3a dre-mir-196b MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001860 None chr3 23673387 23673447 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P4a dre-mir-196a-1 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001276 None chr23 36088111 36088169 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P4b dre-mir-196c MIR-196 AGGUAGU MIMAT0011298 None chr11 2190643 2190701 + Clupeocephala Olfactores No 1
Dre-Mir-199-P1a-v1 dre-mir-199-1 MIR-199 CAGUAGU MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr20 14875474 14875534 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-199-P1a-v2 dre-mir-199-1 MIR-199 ACAGUAG MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr20 14875474 14875534 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-199-P1a-v3 dre-mir-199-1 MIR-199 AGUAGUC MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr20 14875474 14875534 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-199-P2a-v1 dre-mir-199-2 MIR-199 CAGUAGU MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr5 1376779 1376839 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-199-P2a-v2 dre-mir-199-2 MIR-199 ACAGUAG MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr5 1376779 1376839 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-199-P2a-v3 dre-mir-199-2 MIR-199 AGUAGUC MIMAT0001277 MIMAT0003155 chr5 1376779 1376839 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-199-P2b-v1 None MIR-199 CAGUAGU None None chr5 63709623 63709683 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-199-P2b-v2 None MIR-199 ACAGUAG None None chr5 63709623 63709683 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-199-P2b-v3 None MIR-199 AGUAGUC None None chr5 63709623 63709683 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-199-P3-v1 dre-mir-199-3 MIR-199 CAGUAGU MIMAT0001277 MIMAT0031922 chr3 47195159 47195219 - Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-199-P3-v2 dre-mir-199-3 MIR-199 ACAGUAG MIMAT0001277 MIMAT0031922 chr3 47195159 47195219 - Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-199-P3-v3 dre-mir-199-3 MIR-199 AGUAGUC MIMAT0001277 MIMAT0031922 chr3 47195159 47195219 - Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-202 dre-mir-202 MIR-202 UCCUAUG MIMAT0003406 MIMAT0001864 chr13 50602649 50602706 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-203-P1-v1 dre-mir-203b MIR-203 UGAAAUG MIMAT0003407 MIMAT0001865 chr20 27405891 27405949 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-203-P1-v2 dre-mir-203b MIR-203 GAAAUGU MIMAT0003407 MIMAT0001865 chr20 27405891 27405949 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-203-P2-v1 dre-mir-203a MIR-203 UGAAAUG MIMAT0031923 MIMAT0001278 chr17 45808184 45808243 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-203-P2-v2 dre-mir-203a MIR-203 GAAAUGU MIMAT0031923 MIMAT0001278 chr17 45808184 45808243 + Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-204-P1a dre-mir-204-3 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0048659 chr25 34590805 34590862 + Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-204-P1b dre-mir-204-2 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0031987 chr7 29337026 29337083 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-204-P2 dre-mir-204-1 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0031924 chr5 25972085 25972142 + Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-205-P4a dre-mir-205 MIR-205 CCUUCAU MIMAT0001280 MIMAT0031925 chr23 33290291 33290350 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-208-P1 dre-mir-736 MIR-208 UAAGACG None MIMAT0003767 chr2 24261228 24261283 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-210 dre-mir-210 MIR-210 UGUGCGU MIMAT0003392 MIMAT0001281 chr25 25506487 25506548 - Bilateria Bilateria No 1
Dre-Mir-214-P1-v1 dre-mir-214 MIR-214 CAGCAGG None MIMAT0001283 chr20 14877660 14877721 + Clupeocephala Gnathostomata No
Dre-Mir-214-P1-v2 dre-mir-214 MIR-214 ACAGCAG None MIMAT0001283 chr20 14877660 14877721 + Clupeocephala Gnathostomata No
Dre-Mir-216-P2a dre-mir-216b MIR-216 AAUCUCU MIMAT0001867 None chr22 28780265 28780323 - Vertebrata Nephrozoa No 1
Dre-Mir-216-P2b dre-mir-216a MIR-216 AAUCUCA MIMAT0001284 None chr22 28779961 28780023 - Vertebrata Nephrozoa No
Dre-Mir-217-v1 dre-mir-217 MIR-217 ACUGCAU MIMAT0001285 None chr22 28779730 28779788 - Chordata Chordata No 1
Dre-Mir-217-v2 dre-mir-217 MIR-217 UACUGCA MIMAT0001285 None chr22 28779730 28779789 - Chordata Chordata Yes 1
Dre-Mir-218-P2 dre-mir-218a-2 MIR-218 UGUGCUU MIMAT0001868 None chr1 23866891 23866954 + Gnathostomata Vertebrata No 1
Dre-Mir-218-P3 dre-mir-218b MIR-218 UGUGCUU MIMAT0001869 None chr10 17695275 17695332 + Gnathostomata Vertebrata Unknown 1
Dre-Mir-218-P4-v1 dre-mir-218a-1 MIR-218 UGUGCUU MIMAT0001868 None chr14 24562809 24562873 - Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-218-P4-v2 dre-mir-218a-1 MIR-218 CACAUGG MIMAT0001868 None chr14 24562812 24562870 - Gnathostomata Vertebrata No
Dre-Mir-219-P2a dre-mir-219-1 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 None chr10 10329476 10329540 - Clupeocephala Bilateria No 1
Dre-Mir-219-P2b dre-mir-219-2 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 None chr5 65101371 65101437 + Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-219-P3a dre-mir-219-3 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 MIMAT0031989 chr19 18861780 18861840 - Clupeocephala Bilateria No 1 1
Dre-Mir-221-P1a1 dre-mir-222a MIR-221 GCUCAGU MIMAT0031927 MIMAT0001289 chr9 33921481 33921542 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-221-P1c dre-mir-222b MIR-221 GCUACAU None MIMAT0011303 chr21 44568190 44568252 - Gnathostomata Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-221-P2a1 dre-mir-221 MIR-221 GCUACAU MIMAT0031926 MIMAT0001288 chr9 33920955 33921017 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-221-P2a2 None MIR-221 GCUACAU None None chr6 59901710 59901774 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-223 dre-mir-223 MIR-223 GUCAGUU None MIMAT0001290 chr5 22234413 22234477 - Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-338-P1 dre-mir-338-2 MIR-338 CCAGCAU None MIMAT0001873 chr12 17727559 17727620 + Vertebrata Vertebrata No 1 1 1
Dre-Mir-338-P2a dre-mir-338-3 MIR-338 CCAGCAU MIMAT0048672 MIMAT0048673 chr3 51907489 51907549 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-338-P2b dre-mir-338-1 MIR-338 CCAGCAU None MIMAT0001873 chr12 35710532 35710592 - Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-375-P1 dre-mir-375-1 MIR-375 UUGUUCG None MIMAT0001876 chr6 13800103 13800160 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-375-P2 dre-mir-375-2 MIR-375 UUGUUCG None MIMAT0001876 chr9 11571983 11572043 - Clupeocephala Nephrozoa No 1
Dre-Mir-425 dre-mir-731 MIR-425 AUGACAC MIMAT0003761 None chr8 26082548 26082611 + Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-430-o1a dre-mir-430a-1 MIR-430 AAGUGCU None MIMAT0001423 chr10 4493289 4493347 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b1 dre-mir-430a-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28694962 28695020 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b2 dre-mir-430a-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28696703 28696761 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b3 dre-mir-430a-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28699047 28699105 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b4 dre-mir-430a-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28700810 28700868 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b5 dre-mir-430a-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28708442 28708500 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b6 dre-mir-430a-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28706702 28706760 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b7 dre-mir-430a-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28704939 28704997 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b8 dre-mir-430a-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28703199 28703257 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1c dre-mir-430a-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031996 MIMAT0001423 chr4 28701436 28701494 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d1 dre-mir-430a-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031995 MIMAT0001423 chr4 28693846 28693904 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d2 dre-mir-430a-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031997 MIMAT0001423 chr4 28695588 28695646 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d3 dre-mir-430a-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031998 MIMAT0001423 chr4 28697329 28697387 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d4 dre-mir-430a-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031999 MIMAT0001423 chr4 28697933 28697991 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d5 dre-mir-430a-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032000 MIMAT0001423 chr4 28703825 28703883 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d6 dre-mir-430a-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032001 MIMAT0001423 chr4 28709068 28709126 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d7 dre-mir-430a-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032002 MIMAT0001423 chr4 28707328 28707386 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e1 dre-mir-430i-1 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28699673 28699731 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e2 dre-mir-430i-2 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28702062 28702120 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e3 dre-mir-430i-3 MIR-430 CCCUCAC MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28705565 28705623 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a1 dre-mir-430b-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28694231 28694289 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a2 dre-mir-430b-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695382 28695440 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a3 dre-mir-430b-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695972 28696030 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a4 dre-mir-430b-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697727 28697785 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a5 dre-mir-430b-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28699467 28699525 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a6 dre-mir-430b-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28700079 28700137 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a7 dre-mir-430b-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701856 28701914 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a8 dre-mir-430b-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28709466 28709524 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a9 dre-mir-430b-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707712 28707770 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a10 dre-mir-430b-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707122 28707180 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a11 dre-mir-430b-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705971 28706029 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a12 dre-mir-430b-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705359 28705417 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a13 dre-mir-430b-18 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28703619 28703677 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a14 dre-mir-430b-19 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28702468 28702526 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2b dre-mir-430b-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28693640 28693698 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c1 dre-mir-430b-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697123 28697181 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c2 dre-mir-430b-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701230 28701288 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c3 dre-mir-430b-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28708862 28708920 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d1 dre-mir-430b-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28698317 28698375 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d2 dre-mir-430b-20 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28704209 28704267 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o3a1 dre-mir-430c-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693379 28693437 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a2 dre-mir-430c-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693983 28694041 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a3 dre-mir-430c-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695121 28695179 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a4 dre-mir-430c-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695725 28695783 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a5 dre-mir-430c-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28696862 28696920 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a6 dre-mir-430c-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28697466 28697524 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a7 dre-mir-430c-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699206 28699264 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a8 dre-mir-430c-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28709205 28709263 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a9 dre-mir-430c-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28708601 28708659 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a10 dre-mir-430c-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28707465 28707523 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a11 dre-mir-430c-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28706861 28706919 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a12 dre-mir-430c-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28705724 28705782 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a13 dre-mir-430c-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28702221 28702279 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a14 dre-mir-430c-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28701595 28701653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a15 dre-mir-430c-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28700969 28701027 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a16 dre-mir-430c-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699832 28699890 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b1 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28698070 28698128 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b2 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28703962 28704020 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-451 dre-mir-451 MIR-451 AACCGUU MIMAT0001634 chr5 42271979 42272020 - Vertebrata Vertebrata NA
Dre-Mir-455-P1-v1 dre-mir-455-1 MIR-455 AUGUGCC MIMAT0001879 MIMAT0031993 chr5 65250402 65250459 - Clupeocephala Vertebrata No
Dre-Mir-455-P1-v2 dre-mir-455-1 MIR-455 CAGUCCA MIMAT0001879 MIMAT0031993 chr5 65250401 65250460 - Clupeocephala Vertebrata Yes
Dre-Mir-455-P1-v3 dre-mir-455-1 MIR-455 GCAGUCC MIMAT0001879 MIMAT0031993 chr5 65250401 65250460 - Clupeocephala Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-455-P2-v1 dre-mir-455-2 MIR-455 AUGUGCC MIMAT0011302 MIMAT0031993 chr16 51776559 51776616 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-455-P2-v2 dre-mir-455-2 MIR-455 CAGUCCA MIMAT0011302 MIMAT0031993 chr16 51776558 51776617 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-455-P2-v3 dre-mir-455-2 MIR-455 GCAGUCC MIMAT0011302 MIMAT0031993 chr16 51776558 51776617 + Clupeocephala Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-456 dre-mir-456 MIR-456 AGGCUGG None MIMAT0001882 chr17 22827076 22827137 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-458 dre-mir-458 MIR-458 UAGCUCU MIMAT0032005 MIMAT0001885 chr14 25159138 25159195 - Osteichthyes Osteichthyes No 1
Dre-Mir-459 dre-mir-459 MIR-459 CAGUAAC MIMAT0001886 MIMAT0003408 chr1 1575493 1575555 + Vertebrata Vertebrata No 1
Dre-Mir-460-P1 dre-mir-460 MIR-460 ACAGCGC MIMAT0001887 MIMAT0001888 chr2 2301366 2301424 - Osteichthyes Osteichthyes Yes 1 1
Dre-Mir-460-P2 dre-mir-730 MIR-460 CCUCAUU MIMAT0003760 None chr7 23362175 23362234 + Osteichthyes Osteichthyes Yes 1
Dre-Mir-489-v1 dre-mir-489 MIR-489 UGACAUC None MIMAT0002940 chr19 40781190 40781248 - Osteichthyes Osteichthyes No 1
Dre-Mir-489-v2 dre-mir-489 MIR-489 GACAUCA None MIMAT0002940 chr19 40781189 40781249 - Osteichthyes Osteichthyes No 1
Dre-Mir-499-P1 dre-mir-499 MIR-499 UAAGACU MIMAT0003749 MIMAT0032009 chr11 25205169 25205227 - Clupeocephala Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-499-P2 None MIR-499 UAAGACU None None chr23 18731335 18731394 + Clupeocephala Vertebrata No 1
Dre-Mir-551-P2 None MIR-551 CGACCCA None None chr15 35287289 35287345 + Vertebrata Vertebrata No
Dre-Mir-722-P1-v1 None MIR-722 UUUGCAG None None chr3 49815209 49815273 - Clupeocephala Osteichthyes No 1 1
Dre-Mir-722-P1-v2 None MIR-722 UUGCAGA None None chr3 49815209 49815273 - Clupeocephala Osteichthyes Yes 1
Dre-Mir-722-P2-v1 dre-mir-722 MIR-722 UUUGCAG None MIMAT0003748 chr1 56363896 56363960 - Clupeocephala Osteichthyes No 1 1
Dre-Mir-722-P2-v2 dre-mir-722 MIR-722 UUGCAGA None MIMAT0003748 chr1 56363896 56363960 - Clupeocephala Osteichthyes Yes 1
Dre-Mir-723-P2 dre-mir-723 MIR-723 GACAUCA MIMAT0003750 MIMAT0003751 chrUn_KN149706v1 28040 28100 - Clupeocephala Clupeocephala No 1
Dre-Mir-724-P1-v1 None MIR-724 UAAAGGG None None chr8 24064223 24064284 + Clupeocephala Neopterygii No
Dre-Mir-724-P1-v2 None MIR-724 AAAGGGA None None chr8 24064224 24064283 + Clupeocephala Neopterygii No
Dre-Mir-724-P2-v1 dre-mir-724 MIR-724 UAAAGGG MIMAT0003752 None chr11 3176699 3176759 + Clupeocephala Neopterygii No 1
Dre-Mir-724-P2-v2 dre-mir-724 MIR-724 AAAGGGA MIMAT0003752 None chr11 3176700 3176758 + Clupeocephala Neopterygii No
Dre-Mir-725 dre-mir-725 MIR-725 UCAGUCA MIMAT0032010 MIMAT0003753 chr22 24366204 24366259 - Gnathostomata Gnathostomata No 1
Dre-Mir-726 dre-mir-726 MIR-726 UCACUAC None MIMAT0003754 chr11 25476111 25476171 - Osteichthyes Osteichthyes No 1
Dre-Mir-727-P1-v1 dre-mir-727 MIR-727 CAGUCUU MIMAT0003755 MIMAT0003756 chr24 26185423 26185489 + Clupeocephala Osteichthyes No
Dre-Mir-727-P1-v2 dre-mir-727 MIR-727 UUGAGGC MIMAT0003755 MIMAT0003756 chr24 26185425 26185487 + Clupeocephala Osteichthyes No 1
Dre-Mir-728-P1 dre-mir-728 MIR-728 UACUAAG None MIMAT0003757 chr24 26190564 26190624 + Clupeocephala Neopterygii No 1
Dre-Mir-729 dre-mir-729 MIR-729 AUGGGUA None MIMAT0003758 chr4 13584505 13584565 + Neopterygii Neopterygii No
Dre-Mir-732 dre-mir-732 MIR-732 UCAAAGC None MIMAT0003762 chr9 41682940 41682998 + D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-734 dre-mir-734 MIR-734 AAAUGCU None MIMAT0003765 chr1 34122894 34122960 + Neopterygii Neopterygii No 1 1
Dre-Mir-737 dre-mir-737 MIR-737 UUUUUUU MIMAT0032013 MIMAT0003768 chr18 45962916 45962976 + Osteichthyes Osteichthyes No 1 1
Dre-Mir-1306 dre-mir-1306 MIR-1306 CACCUCC MIMAT0028210 None chr5 24521686 24521746 + Gnathostomata Gnathostomata Yes 1 1
Dre-Mir-1388 dre-mir-1388 MIR-1388 UCUCAGG MIMAT0011292 MIMAT0011293 chr23 13604240 13604298 + Gnathostomata Gnathostomata No
Dre-Mir-1788 dre-mir-1788 MIR-1788 GCUUGUU MIMAT0011294 MIMAT0011295 chr9 11551626 11551682 - Vertebrata Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-2184-P1a dre-mir-2184 MIR-2184 ACAGUAA MIMAT0011288 None chr10 35654276 35654332 - D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2184-P1b None MIR-2184 ACAGUAA None None LKPD01047922.1 7188 7244 + D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2188 dre-mir-2188 MIR-2188 AGGUCCA MIMAT0011309 MIMAT0011310 chr5 69021881 69021940 - Gnathostomata Gnathostomata Yes 1 1
Dre-Mir-2189 dre-mir-2189 MIR-2189 GAUUGUU None MIMAT0011311 chrUn_KN150127v1 17180 17237 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-2191 dre-mir-2191 MIR-2191 CACACCU None MIMAT0011300 chr23 36790250 36790310 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-7132-P1 dre-mir-7132 MIR-7132 ACUUGGU MIMAT0048669 MIMAT0048670 chr3 59063772 59063829 + Clupeocephala Clupeocephala No 1 1
Dre-Mir-7133 dre-mir-7133 MIR-7133 AGUUUGA MIMAT0048664 MIMAT0048665 chr8 10020272 10020332 + Clupeocephala Clupeocephala No 1
Dre-Mir-7147 dre-mir-7147 MIR-7147 GUACCAU MIMAT0028205 None chr24 10948075 10948132 - Osteichthyes Osteichthyes No
Dre-Mir-7148 dre-mir-7148 MIR-7148 AUGGAAA MIMAT0028206 MIMAT0028207 chr2 57103411 57103473 - D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-7149 dre-mir-7149 MIR-7149 UCCAAGU MIMAT0028208 MIMAT0028209 chr23 24074089 24074151 + D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-1 None DRE-NOVEL-1 AUUUUCU None None chr18 15584378 15584438 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-2 None DRE-NOVEL-2 UAUGUGU None None chr19 6275796 6275851 - D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-3 None DRE-NOVEL-3 CUGAUCA None None chr17 52860985 52861045 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-4 None DRE-NOVEL-4 CAGGAAU None None chr15 37725346 37725406 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-5 None DRE-NOVEL-5 CAUGUCA None None chr9 56359312 56359379 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-6 None DRE-NOVEL-6 ACAAGGG None None chr3 26193747 26193808 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-7 None DRE-NOVEL-7 GGGCGAU None None chr22 364003 364066 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-8 None DRE-NOVEL-8 AAAUAAU None None chr4 6920268 6920338 + D. rerio D. rerio No 1 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all

Download genome coordinates (GFF format)

Download count matrix